204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0737.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  89.06 
 
 
501 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  88.89 
 
 
498 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  88.89 
 
 
498 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  88.89 
 
 
498 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  92.06 
 
 
498 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  92.06 
 
 
498 aa  329  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  91.53 
 
 
498 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  75.52 
 
 
502 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  73.68 
 
 
496 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  75.81 
 
 
496 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  72.77 
 
 
499 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  60.47 
 
 
527 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  55.5 
 
 
527 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  61.73 
 
 
532 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  56.73 
 
 
552 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  54.34 
 
 
565 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  58.33 
 
 
640 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  58.28 
 
 
616 aa  178  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  56.79 
 
 
543 aa  175  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  55.76 
 
 
546 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  55.76 
 
 
546 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  55.76 
 
 
546 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  56.63 
 
 
545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  56.63 
 
 
545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  56.63 
 
 
545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  56.63 
 
 
545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  55.56 
 
 
543 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  56.02 
 
 
545 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  51.74 
 
 
568 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  58.09 
 
 
568 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  50 
 
 
527 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  54.37 
 
 
505 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  54.79 
 
 
535 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  46 
 
 
548 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  48.78 
 
 
565 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  49.64 
 
 
501 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  48.17 
 
 
576 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  39.47 
 
 
485 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  39.47 
 
 
485 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  43.33 
 
 
467 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  42.11 
 
 
467 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  42.76 
 
 
464 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  42.11 
 
 
464 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  41.61 
 
 
463 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  42.28 
 
 
466 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  48.97 
 
 
478 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  42.95 
 
 
467 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  48.28 
 
 
509 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
577 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
476 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
479 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
476 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
476 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  48.28 
 
 
557 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  37.58 
 
 
470 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  38.71 
 
 
518 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.47 
 
 
486 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  41.67 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  36.76 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  36.76 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  40.65 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  39.1 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  42.76 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  36.92 
 
 
581 aa  75.9  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.48 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  32.08 
 
 
671 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  34.04 
 
 
537 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  42.76 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  32.45 
 
 
494 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  35.51 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  36.96 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  33.58 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  36.11 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  36.23 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  30.46 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  35.29 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  36.3 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  32.65 
 
 
491 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  34.62 
 
 
468 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  35.21 
 
 
581 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  35.21 
 
 
581 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  32.86 
 
 
584 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  34.06 
 
 
585 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  32.09 
 
 
610 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  34.06 
 
 
589 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  36.88 
 
 
455 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  34.97 
 
 
476 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>