224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1350 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 498 aa  823    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  100 
 
 		 496 aa  1023    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 498 aa  823    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  78.23 
 
 		 498 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  78.23 
 
 		 498 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  78.23 
 
 		 498 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 501 aa  823    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  82.46 
 
 		 499 aa  854    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 498 aa  823    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  81.05 
 
 		 502 aa  853    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  87.1 
 
 		 496 aa  913    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  58.07 
 
 		 527 aa  571  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  57.91 
 
 		 543 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  57.7 
 
 		 546 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  57.91 
 
 		 546 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  57.46 
 
 		 543 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  57.7 
 
 		 546 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 545 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 545 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  53.7 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  55.08 
 
 		 527 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  58.11 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  54.09 
 
 		 616 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  55.07 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  51.38 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  52.5 
 
 		 640 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  48.13 
 
 		 565 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  50 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  49.03 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  45.58 
 
 		 568 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  46.08 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  43.62 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  45.67 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  46.71 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  40.69 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  41.77 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  40.26 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  37.07 
 
 		 518 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39.09 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.84 
 
 		 470 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  40.38 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  41.2 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  37.86 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  38.59 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.87 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  75.81 
 
 		 215 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.74 
 
 		 486 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.78 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.78 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.56 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.56 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.56 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.56 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.79 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.34 
 
 		 467 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.38 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  39.34 
 
 		 557 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  39.13 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  39.13 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  39.13 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  39.13 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  39.13 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  39.13 
 
 		 577 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  38.11 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  38.33 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  36.76 
 
 		 480 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  29.01 
 
 		 671 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.24 
 
 		 589 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  30.02 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  31.52 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.46 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.42 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.21 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  27.93 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  28.31 
 
 		 506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.28 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.93 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.83 
 
 		 581 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  30.28 
 
 		 635 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  29.09 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  27.94 
 
 		 609 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  28.99 
 
 		 584 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  29 
 
 		 584 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  34.93 
 
 		 676 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  26.32 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  28.25 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  28.48 
 
 		 585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  28.48 
 
 		 585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  28.14 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  29.68 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  30.46 
 
 		 525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  31.36 
 
 		 589 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  28.51 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  28.72 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  28.69 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  28.69 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>