228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0502 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  73.84 
 
 
559 aa  851    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  100 
 
 
554 aa  1142    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  55.84 
 
 
525 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  55.1 
 
 
530 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  54.83 
 
 
525 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  34.77 
 
 
454 aa  269  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  33.2 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.01 
 
 
434 aa  217  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  39.39 
 
 
455 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  34.58 
 
 
461 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  35 
 
 
461 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  35 
 
 
461 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  35 
 
 
461 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  35 
 
 
461 aa  173  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  35 
 
 
461 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  35.2 
 
 
436 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
461 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
461 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  37.13 
 
 
388 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  34.44 
 
 
461 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  32.85 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  37.57 
 
 
464 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  36.17 
 
 
506 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  35.71 
 
 
450 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
467 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  31.91 
 
 
335 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  34.24 
 
 
474 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  34.24 
 
 
474 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  33.99 
 
 
463 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
455 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  35.89 
 
 
426 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  34.56 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.64 
 
 
541 aa  157  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.15 
 
 
466 aa  157  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  35.48 
 
 
547 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  35.59 
 
 
505 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  34.3 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  33.07 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.33 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  32.15 
 
 
553 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  28.39 
 
 
477 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  33.05 
 
 
467 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
557 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  33.53 
 
 
489 aa  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  31.96 
 
 
557 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.83 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  32.34 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  31.96 
 
 
557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  31.67 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  32.54 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  31.94 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  31.74 
 
 
485 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  33.89 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  29.33 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
575 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  33.61 
 
 
464 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  35.13 
 
 
558 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  30.99 
 
 
557 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  35.33 
 
 
616 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  31.93 
 
 
503 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  28.94 
 
 
439 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  31.54 
 
 
485 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  34.36 
 
 
606 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  33.06 
 
 
499 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  33.06 
 
 
499 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  33.06 
 
 
499 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  35.17 
 
 
457 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  33.93 
 
 
543 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  33.75 
 
 
478 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
486 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  30.21 
 
 
575 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  28.74 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  32.15 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  28.74 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  30.95 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  32 
 
 
607 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  28.74 
 
 
425 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
480 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  34.17 
 
 
584 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  31.84 
 
 
470 aa  140  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  31.83 
 
 
671 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  33.64 
 
 
454 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  32.97 
 
 
548 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
527 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
464 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
464 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  32.87 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  32.93 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>