227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3974 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  74.66 
 
 		 476 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  100 
 
 		 457 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  73.71 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  72.66 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  68.77 
 
 		 455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  72.66 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  72.91 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  68.42 
 
 		 445 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  72.41 
 
 		 439 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  69.93 
 
 		 543 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  72.36 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  72.36 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  72.36 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  68.87 
 
 		 492 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  72.32 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  65.76 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  46.75 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  48.02 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  46.38 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  48.13 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  50.96 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  50.47 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  46.32 
 
 		 461 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  46.32 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  46.57 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  46.32 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  46.32 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  46.08 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  46.08 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  46.08 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  46.32 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  46.08 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  44.61 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  39.53 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  36.38 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  36.38 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  38.1 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  35.52 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  35.04 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  33.12 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.59 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  30.72 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.75 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  32.56 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  32.79 
 
 		 541 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  32.34 
 
 		 589 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  34.38 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.5 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  30.06 
 
 		 557 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.22 
 
 		 557 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  31.22 
 
 		 557 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  31.36 
 
 		 557 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 557 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  35.26 
 
 		 335 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  31.65 
 
 		 557 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  30.06 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  30.06 
 
 		 557 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  29.65 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  32.04 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134835 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.71 
 
 		 606 aa  182  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  29.48 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.35 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  31.77 
 
 		 530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  30.16 
 
 		 548 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  37.17 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  37.17 
 
 		 471 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  37.17 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  36.87 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  36.5 
 
 		 471 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  38 
 
 		 388 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 471 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  30.77 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.4 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  28.48 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  33.67 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  34.69 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  31.93 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  29.67 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.57 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  29.38 
 
 		 437 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  28.81 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  29.12 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0890  alkaline phosphatase, putative  27.68 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  34.57 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  35.17 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.06 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.61 
 
 		 525 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  33.12 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  30.84 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  28.9 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  27.58 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  28.85 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  34.84 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  33.84 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  29.89 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  28.16 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>