225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1963 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  100 
 
 
477 aa  981    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  54.3 
 
 
429 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  45.88 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  50.11 
 
 
488 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  47.03 
 
 
425 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  47.33 
 
 
439 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  47.33 
 
 
439 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  47.33 
 
 
439 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  48.86 
 
 
440 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  46.17 
 
 
457 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  47.06 
 
 
445 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  46.34 
 
 
461 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  47.73 
 
 
470 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  47.73 
 
 
464 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  47.73 
 
 
464 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  44.56 
 
 
464 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  46.36 
 
 
492 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  45.97 
 
 
543 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  47.26 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  43.39 
 
 
480 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  44.9 
 
 
476 aa  351  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  45.72 
 
 
473 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  41.19 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  41.19 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  41.19 
 
 
461 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  40.98 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  40.78 
 
 
461 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  40.57 
 
 
461 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  40.78 
 
 
461 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  40.78 
 
 
461 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  40.57 
 
 
461 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  40.57 
 
 
461 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  40.57 
 
 
461 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  38.38 
 
 
474 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  38.38 
 
 
474 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  36.25 
 
 
489 aa  280  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  35.25 
 
 
455 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  31.56 
 
 
434 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.33 
 
 
434 aa  194  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  32.78 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
436 aa  187  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.3 
 
 
506 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  32.24 
 
 
606 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
433 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  30.65 
 
 
454 aa  176  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  29.78 
 
 
547 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  30.02 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  29.76 
 
 
541 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
501 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  30.42 
 
 
487 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  29.63 
 
 
536 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  29.68 
 
 
501 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  29.98 
 
 
481 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  28.7 
 
 
554 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  30.68 
 
 
486 aa  160  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  29.88 
 
 
481 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.49 
 
 
589 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  27.39 
 
 
494 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.74 
 
 
557 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.74 
 
 
557 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.74 
 
 
557 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  28.71 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  29.17 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  28.54 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  28.54 
 
 
557 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  28.95 
 
 
553 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  29.23 
 
 
557 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  29.19 
 
 
557 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  26.58 
 
 
530 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
557 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  29.98 
 
 
501 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.92 
 
 
525 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  26.78 
 
 
525 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  27.8 
 
 
559 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  34.41 
 
 
450 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  28.12 
 
 
469 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  38.11 
 
 
426 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  29.01 
 
 
335 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  28.14 
 
 
548 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  35.39 
 
 
388 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  27.88 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  30.59 
 
 
492 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  31.91 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  31.95 
 
 
503 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  27.48 
 
 
575 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  31.31 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  31.66 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  26.75 
 
 
575 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  26.87 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  30.32 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.07 
 
 
481 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  27.69 
 
 
537 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0924  Alkaline phosphatase  27.37 
 
 
527 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000229427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  27.22 
 
 
609 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>