224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2472 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  100 
 
 
481 aa  984    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  54.75 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  53.12 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  50.1 
 
 
501 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  54.53 
 
 
486 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  53.2 
 
 
490 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  50.46 
 
 
491 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  46.44 
 
 
487 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  45.81 
 
 
494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  41.51 
 
 
537 aa  349  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  39.23 
 
 
537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0924  Alkaline phosphatase  39.36 
 
 
527 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000229427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  35.43 
 
 
434 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  35.04 
 
 
434 aa  194  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  34.36 
 
 
455 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  30.44 
 
 
547 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
436 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  29.57 
 
 
536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.18 
 
 
506 aa  166  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  32.52 
 
 
461 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  31.07 
 
 
557 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  33.63 
 
 
492 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  32.52 
 
 
439 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
439 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  31.3 
 
 
557 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  32.52 
 
 
439 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  30.34 
 
 
400 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  32.52 
 
 
425 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  30.41 
 
 
455 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  31.94 
 
 
440 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  31.15 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  31.15 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  32.08 
 
 
445 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  30.49 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  30.48 
 
 
548 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  29.88 
 
 
477 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  30.65 
 
 
553 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  29.49 
 
 
557 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  32.11 
 
 
557 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  27.11 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  30.85 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  30.9 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  28.25 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  28.25 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.33 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  32.5 
 
 
543 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  29.98 
 
 
480 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  27.48 
 
 
454 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  30.38 
 
 
464 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
557 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  29.56 
 
 
433 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  29.94 
 
 
473 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  30.75 
 
 
429 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  31.4 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  31.47 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  30.46 
 
 
671 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.82 
 
 
525 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  30.67 
 
 
461 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  30.65 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  32.89 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  30.44 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  30.44 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  30.44 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  30.44 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  30.18 
 
 
503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  30.44 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  30.67 
 
 
461 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  30.67 
 
 
461 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  31.32 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  30.31 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  30.22 
 
 
461 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  30.87 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  27.37 
 
 
582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  27.9 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.96 
 
 
541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  30.89 
 
 
610 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  30.47 
 
 
525 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  30.38 
 
 
558 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  28.4 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  27.94 
 
 
584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  28.31 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  28.54 
 
 
585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
463 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  27.31 
 
 
584 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.13 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.13 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.13 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.13 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 
467 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 
467 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.52 
 
 
481 aa  114  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  31.71 
 
 
466 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  32.83 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  31.93 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  27.67 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  32.48 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  27.63 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>