226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1098 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  100 
 
 		 473 aa  979    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  64.88 
 
 		 464 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  62.93 
 
 		 480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  47.94 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  50.35 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  50.58 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  50.35 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  46.93 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  50.35 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  50.35 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  47.72 
 
 		 457 aa  362  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  49.65 
 
 		 543 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  49.21 
 
 		 454 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  45.72 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  49.88 
 
 		 470 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  49.88 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  49.88 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  44.59 
 
 		 492 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  46.23 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  48.83 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  46.5 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  43.13 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.75 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  40.09 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  39.74 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  39.87 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  39.74 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  39.52 
 
 		 461 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  39.31 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  39.19 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  39.19 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  39.19 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  35.98 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  35.98 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  35.08 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.56 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.62 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  28.41 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 560 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  31.02 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  31.96 
 
 		 589 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.35 
 
 		 606 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.04 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  29.59 
 
 		 454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  28.2 
 
 		 557 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.09 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.09 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  27.4 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  28.43 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  27.36 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  36.72 
 
 		 388 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  27.45 
 
 		 557 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.2 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  28.89 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  27.53 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  29.46 
 
 		 501 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  31.69 
 
 		 525 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  32.46 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  27.8 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  29.91 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.58 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  27.6 
 
 		 557 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  35.76 
 
 		 607 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  30.45 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  32.11 
 
 		 335 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  25.42 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  31.33 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  32.93 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0870  Alkaline phosphatase  36.18 
 
 		 381 aa  140  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  31.15 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  32.65 
 
 		 559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  30.6 
 
 		 501 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.38 
 
 		 464 aa  136  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  29.62 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  29.71 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  26.77 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  32.52 
 
 		 610 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  32.23 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  32.54 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  31.53 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  30.02 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  31.83 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  31.55 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  35.09 
 
 		 608 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  32.54 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  33.02 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  31.72 
 
 		 471 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  28.37 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  28.21 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  31.03 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>