233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1383 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  100 
 
 
608 aa  1255    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  51.76 
 
 
610 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  48.92 
 
 
607 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4822  alkaline phosphatase  53.14 
 
 
261 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0870  Alkaline phosphatase  34.86 
 
 
381 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.59 
 
 
434 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.1 
 
 
434 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  39.02 
 
 
474 aa  174  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  39.02 
 
 
474 aa  174  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  37 
 
 
547 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  37.72 
 
 
455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.35 
 
 
450 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1372  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.65 
 
 
252 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0780489  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  34.97 
 
 
489 aa  161  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  35.25 
 
 
454 aa  160  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  35.92 
 
 
461 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  35.92 
 
 
461 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  35.42 
 
 
464 aa  153  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2129  secreted protein  33.1 
 
 
288 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  33.81 
 
 
388 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.07 
 
 
525 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  35.6 
 
 
461 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  35.82 
 
 
455 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  37.21 
 
 
461 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  30.88 
 
 
471 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  31.6 
 
 
471 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  31.6 
 
 
471 aa  150  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  35.29 
 
 
560 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  31.73 
 
 
525 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  31.6 
 
 
471 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  30.37 
 
 
471 aa  150  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  31.11 
 
 
471 aa  150  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  31.11 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  35 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  31.77 
 
 
476 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3533  hypothetical protein  33.81 
 
 
323 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  36.42 
 
 
501 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
440 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  30.12 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  30.6 
 
 
475 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
439 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 
426 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  37.89 
 
 
480 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  36.33 
 
 
433 aa  140  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  33.78 
 
 
537 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
439 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  34.12 
 
 
487 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  34.72 
 
 
439 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  36.56 
 
 
436 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
425 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
464 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
464 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3513  hypothetical protein  36.29 
 
 
646 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  34.72 
 
 
470 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  34.38 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1530  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.39 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  31.39 
 
 
476 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  36 
 
 
506 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  31.29 
 
 
554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  33.79 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  31.15 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  36.42 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  32.83 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  33.45 
 
 
477 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  36.58 
 
 
490 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  34.04 
 
 
461 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.58 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  34.86 
 
 
457 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  34.17 
 
 
476 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  28.8 
 
 
553 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.3 
 
 
548 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22760  hypothetical protein  35.39 
 
 
296 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.488821  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  35.57 
 
 
486 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  32.67 
 
 
445 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  28.75 
 
 
481 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  28.75 
 
 
481 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  28.75 
 
 
481 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  35.44 
 
 
464 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  32.86 
 
 
543 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  29.1 
 
 
454 aa  125  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  29.39 
 
 
557 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  30.38 
 
 
557 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  29.9 
 
 
541 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  27.55 
 
 
557 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  35.09 
 
 
473 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
557 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4257  secreted protein  32.81 
 
 
311 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.256358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  29.75 
 
 
558 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  32.93 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  27.08 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>