226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0512 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  100 
 
 
521 aa  1085    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  45.02 
 
 
631 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  44.72 
 
 
615 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  39.48 
 
 
497 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3638  Alkaline phosphatase  36.68 
 
 
515 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  30.46 
 
 
945 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.37 
 
 
464 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  30.24 
 
 
450 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  31.95 
 
 
455 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.01 
 
 
525 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.39 
 
 
525 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  33.16 
 
 
554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
2701 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  31.38 
 
 
559 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  30.86 
 
 
426 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  27.91 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  32.1 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  30.71 
 
 
530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  29.04 
 
 
1587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  33.71 
 
 
487 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  26.84 
 
 
474 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  26.84 
 
 
474 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.52 
 
 
2852 aa  144  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  32.1 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.62 
 
 
3977 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  31.81 
 
 
543 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  31.46 
 
 
440 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  30.05 
 
 
454 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  31.89 
 
 
476 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2010  Alkaline phosphatase  30.08 
 
 
627 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.208798  normal  0.40879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  30.92 
 
 
537 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  30.7 
 
 
439 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1983  Alkaline phosphatase  30.08 
 
 
627 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  28.2 
 
 
388 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  30.59 
 
 
425 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  30.59 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  30.59 
 
 
439 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  29.95 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  26.65 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
470 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
464 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
464 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  30.24 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
2182 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  26.24 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  29.56 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  29.86 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  27.33 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  27.98 
 
 
461 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
461 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  33.68 
 
 
501 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
557 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  27.93 
 
 
461 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
494 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
557 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  27.87 
 
 
461 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  30.83 
 
 
471 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  30.29 
 
 
471 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  29.82 
 
 
689 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  27.02 
 
 
461 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  27.02 
 
 
461 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.89 
 
 
557 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  30.29 
 
 
471 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  30.29 
 
 
471 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  27.7 
 
 
461 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  30.33 
 
 
548 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  30.29 
 
 
471 aa  123  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  30.03 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  29.62 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  30.29 
 
 
471 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  30.29 
 
 
471 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  28.88 
 
 
541 aa  121  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  27.48 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  27.48 
 
 
461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  30.03 
 
 
557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  29.21 
 
 
475 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  30.07 
 
 
480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  29.5 
 
 
608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  28.07 
 
 
557 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  30.26 
 
 
471 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  29.21 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  28.65 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  26.24 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  30.17 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  29.04 
 
 
506 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  33.24 
 
 
491 aa  115  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  29.29 
 
 
476 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  26.61 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  30.08 
 
 
609 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  27.65 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  29.97 
 
 
557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.18 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  28.4 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  28.18 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3159  Alkaline phosphatase  30.56 
 
 
571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0625023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  29.7 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0870  Alkaline phosphatase  29.17 
 
 
381 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  29.79 
 
 
433 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  30.43 
 
 
501 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>