226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1946 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  74.15 
 
 
471 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  75.37 
 
 
471 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  74.15 
 
 
471 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  73.72 
 
 
471 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  74.36 
 
 
471 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  79.37 
 
 
475 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  100 
 
 
481 aa  990    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  68.3 
 
 
481 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  100 
 
 
481 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  71.25 
 
 
476 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  100 
 
 
481 aa  990    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  70.25 
 
 
454 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  73.72 
 
 
471 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  75.37 
 
 
471 aa  723    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  70.82 
 
 
476 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  78.51 
 
 
467 aa  701    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  74.36 
 
 
471 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  74.09 
 
 
471 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  58.86 
 
 
492 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  42.76 
 
 
611 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  41.96 
 
 
635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  40.72 
 
 
468 aa  289  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  33.26 
 
 
499 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  33.26 
 
 
499 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  33.26 
 
 
499 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  37.99 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  34.26 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
474 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
474 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  32.73 
 
 
489 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  36.63 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.75 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  32.12 
 
 
505 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  36.66 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  30.34 
 
 
433 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  35.96 
 
 
461 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  34.69 
 
 
581 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  35.48 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.55 
 
 
671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.11 
 
 
434 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  34.68 
 
 
426 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  30.51 
 
 
467 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  35.77 
 
 
501 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
464 aa  143  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.68 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  36.11 
 
 
565 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  32.64 
 
 
455 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  30.82 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  30.82 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  33.66 
 
 
478 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  34.81 
 
 
466 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.89 
 
 
548 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  32.23 
 
 
503 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  34.25 
 
 
463 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  33.98 
 
 
467 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  33.98 
 
 
467 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  33.98 
 
 
467 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  32.29 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  32.39 
 
 
585 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  32.46 
 
 
454 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  34.16 
 
 
568 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.7 
 
 
467 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.7 
 
 
467 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.7 
 
 
467 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.7 
 
 
467 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  32.69 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.92 
 
 
541 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  29.03 
 
 
469 aa  133  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  28.77 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  31.79 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.79 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  29.85 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  32.77 
 
 
584 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  31.2 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  31.2 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  32.86 
 
 
584 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 
498 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  31.9 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  32.05 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  33.88 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  33.88 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  34.15 
 
 
546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  34.15 
 
 
546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  31.75 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  33.88 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  33.88 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>