69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1228 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  63.59 
 
 		 589 aa  790    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  62.75 
 
 		 589 aa  786    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1237    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 629 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  39.2 
 
 		 635 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  40.18 
 
 		 624 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.82 
 
 		 624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  40 
 
 		 624 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  40.72 
 
 		 624 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  40.29 
 
 		 627 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  40.22 
 
 		 624 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.08 
 
 		 624 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  38.28 
 
 		 624 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  39.86 
 
 		 624 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  39.46 
 
 		 624 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.31 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  36.59 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  38.85 
 
 		 1355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  38.83 
 
 		 592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  38.86 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  39.67 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  35.74 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.88 
 
 		 774 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  37.96 
 
 		 1587 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38.87 
 
 		 567 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  36.24 
 
 		 633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  37.68 
 
 		 857 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  37.64 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  37.52 
 
 		 621 aa  306  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  34.6 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  35.38 
 
 		 539 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  35.19 
 
 		 622 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  35.2 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  35.91 
 
 		 1322 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  35.61 
 
 		 576 aa  289  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  33.88 
 
 		 575 aa  286  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.46 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  36.48 
 
 		 498 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  37.47 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.09 
 
 		 501 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 1795 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.69 
 
 		 2701 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  31.42 
 
 		 2182 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.51 
 
 		 2796 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 1175 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 3977 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  30.28 
 
 		 2852 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  24.41 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 		 1641 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 1641 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.08 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  35.79 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  38.82 
 
 		 754 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  28.74 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  30 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  39.58 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  26.74 
 
 		 793 aa  57.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25 
 
 		 760 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  25.98 
 
 		 732 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  24.31 
 
 		 721 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  25.33 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  26.15 
 
 		 732 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  25.33 
 
 		 723 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  24.2 
 
 		 729 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  22.51 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  24.56 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  23.08 
 
 		 720 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  31.03 
 
 		 719 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  29.81 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>