67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1175    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  43.52 
 
 
567 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.77 
 
 
774 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  38.2 
 
 
1355 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  41.1 
 
 
533 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  39.59 
 
 
551 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  38.74 
 
 
539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  38.56 
 
 
539 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.23 
 
 
600 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  39.11 
 
 
1587 aa  300  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  34.68 
 
 
592 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  34.85 
 
 
635 aa  293  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  34.58 
 
 
624 aa  287  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  34.67 
 
 
633 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  34.88 
 
 
624 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  34.88 
 
 
624 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  38.34 
 
 
576 aa  280  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  34.41 
 
 
624 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  34.29 
 
 
624 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  34.23 
 
 
624 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  36.1 
 
 
857 aa  277  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  35.07 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
624 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  34.05 
 
 
624 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  34.67 
 
 
622 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  34.94 
 
 
546 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  34.46 
 
 
601 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  33.84 
 
 
589 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  34.51 
 
 
598 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  33.09 
 
 
624 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  32.12 
 
 
622 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  34.29 
 
 
589 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  33.96 
 
 
575 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  35.8 
 
 
498 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  31.55 
 
 
621 aa  253  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  34.24 
 
 
600 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  32.62 
 
 
1322 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  35.08 
 
 
501 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  36.82 
 
 
2701 aa  230  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  33.86 
 
 
506 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  33.77 
 
 
2182 aa  213  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.84 
 
 
1795 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.08 
 
 
2796 aa  200  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  40.75 
 
 
1175 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  26.96 
 
 
423 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  35.53 
 
 
2852 aa  94.7  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.33 
 
 
3977 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  24.93 
 
 
760 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  26.32 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.71 
 
 
754 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  35.34 
 
 
723 aa  64.7  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  35.35 
 
 
723 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  35.35 
 
 
723 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.93 
 
 
1641 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  37.11 
 
 
720 aa  57.4  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.21 
 
 
775 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  34.38 
 
 
719 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 
1641 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  34.34 
 
 
721 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.08 
 
 
732 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  28.43 
 
 
729 aa  47.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  27.92 
 
 
729 aa  47.4  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  25.98 
 
 
732 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  33.01 
 
 
733 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  30.41 
 
 
793 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  27.52 
 
 
776 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>