67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3328 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  59.21 
 
 		 729 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  57.46 
 
 		 732 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  57.89 
 
 		 732 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  61.33 
 
 		 719 aa  854    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  63.38 
 
 		 731 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  58.92 
 
 		 729 aa  801    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1439    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  79.75 
 
 		 723 aa  1160    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  47.66 
 
 		 754 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  67.91 
 
 		 720 aa  957    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  57.18 
 
 		 733 aa  808    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  47.66 
 
 		 754 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  59.97 
 
 		 723 aa  862    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  80.31 
 
 		 723 aa  1166    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  48.43 
 
 		 760 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  43.55 
 
 		 776 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  43.67 
 
 		 775 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  41.78 
 
 		 793 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  38.84 
 
 		 423 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  27.09 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  24.94 
 
 		 501 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  24.35 
 
 		 506 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 		 1641 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.48 
 
 		 1641 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  26.28 
 
 		 857 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  24.48 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  22.83 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 3977 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  24.37 
 
 		 1587 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  24.5 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 2701 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  21.65 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  26.16 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  36 
 
 		 2852 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  22.05 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  22.46 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  22.08 
 
 		 624 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  27.48 
 
 		 622 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  22.3 
 
 		 624 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  30.94 
 
 		 1355 aa  54.3  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  23.58 
 
 		 635 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  32.84 
 
 		 576 aa  54.3  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  21.63 
 
 		 624 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  28.71 
 
 		 453 aa  54.3  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.34 
 
 		 599 aa  53.9  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  25 
 
 		 633 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32.3 
 
 		 2796 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  25.78 
 
 		 533 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.67 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  25.08 
 
 		 539 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  22.16 
 
 		 624 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  21.85 
 
 		 624 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  32.54 
 
 		 2182 aa  52  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  22.77 
 
 		 627 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  27.33 
 
 		 598 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  30.53 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  27.59 
 
 		 589 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.82 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.1 
 
 		 774 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  25.5 
 
 		 600 aa  47.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  26.72 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  23.42 
 
 		 592 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  32.65 
 
 		 567 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  29.81 
 
 		 601 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  31.76 
 
 		 621 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  27.08 
 
 		 451 aa  44.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  28.91 
 
 		 451 aa  44.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>