83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3414 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1025    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  57.43 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  53.46 
 
 
498 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  51.69 
 
 
1587 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  43.24 
 
 
1322 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  43.68 
 
 
592 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  46.27 
 
 
539 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  46.06 
 
 
539 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  44.26 
 
 
546 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  38.95 
 
 
576 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.34 
 
 
857 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
629 aa  346  7e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  39.02 
 
 
575 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  41.99 
 
 
1355 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  40.98 
 
 
533 aa  329  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  37.99 
 
 
633 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  39.11 
 
 
635 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  39.21 
 
 
551 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  38.89 
 
 
624 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  38.93 
 
 
624 aa  309  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  35.34 
 
 
622 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  38.91 
 
 
624 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  38.67 
 
 
624 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
624 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  37.79 
 
 
627 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.05 
 
 
624 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
624 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  39.01 
 
 
624 aa  292  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  38.81 
 
 
624 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  35.59 
 
 
600 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  41.79 
 
 
2701 aa  276  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.5 
 
 
774 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  35.22 
 
 
567 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  37.82 
 
 
589 aa  266  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  37.89 
 
 
601 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.98 
 
 
2182 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  37.26 
 
 
589 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  33.51 
 
 
622 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  32.49 
 
 
621 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  33.27 
 
 
600 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  32.61 
 
 
598 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.08 
 
 
2796 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.13 
 
 
1795 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.25 
 
 
599 aa  226  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  49.56 
 
 
1175 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  30.11 
 
 
423 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.91 
 
 
3977 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  44.53 
 
 
2852 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
1641 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.81 
 
 
1641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  26.88 
 
 
775 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  28.15 
 
 
793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  25.54 
 
 
776 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  27.25 
 
 
733 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  27.23 
 
 
723 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  27.09 
 
 
754 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  27.19 
 
 
754 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25.99 
 
 
760 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  25.39 
 
 
720 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  25.11 
 
 
723 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  25.88 
 
 
723 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  24.57 
 
 
721 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.77 
 
 
731 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.49 
 
 
729 aa  97.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.71 
 
 
729 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  24.89 
 
 
719 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.94 
 
 
732 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.26 
 
 
732 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.4 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 
347 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.37 
 
 
345 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.21 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.23 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.91 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.66 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 
336 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 
689 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  25 
 
 
721 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.15 
 
 
362 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.57 
 
 
348 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.64 
 
 
329 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.83 
 
 
348 aa  43.5  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.67 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>