70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0876 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  59.43 
 
 		 720 aa  815    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  62.78 
 
 		 723 aa  855    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  62.07 
 
 		 723 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  71.1 
 
 		 732 aa  1027    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  62.33 
 
 		 729 aa  903    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  56.14 
 
 		 723 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  62.09 
 
 		 733 aa  898    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  62.24 
 
 		 721 aa  864    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  70.84 
 
 		 732 aa  1025    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  55.28 
 
 		 719 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 731 aa  1464    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  61.78 
 
 		 729 aa  894    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  44.4 
 
 		 754 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  44.54 
 
 		 754 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  44.4 
 
 		 760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  42.48 
 
 		 776 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  42.48 
 
 		 775 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  41.74 
 
 		 793 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  37.47 
 
 		 423 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  26.54 
 
 		 501 aa  87.8  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  40.46 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 1641 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.04 
 
 		 1641 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  24.34 
 
 		 624 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  35.9 
 
 		 506 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  24.8 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  24.58 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  24.03 
 
 		 624 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  28.31 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  24.29 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  23.99 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  24.54 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  24.61 
 
 		 624 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  27.94 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  23.5 
 
 		 624 aa  65.1  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  24.02 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.02 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  23.49 
 
 		 627 aa  61.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  23.56 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.29 
 
 		 2701 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  29.17 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  28.25 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  28.21 
 
 		 1355 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.72 
 
 		 1175 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  40.23 
 
 		 600 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 		 3977 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  25.93 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  23.47 
 
 		 1587 aa  54.3  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  22.87 
 
 		 857 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  27.57 
 
 		 451 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.17 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.12 
 
 		 454 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  38.1 
 
 		 1322 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  26.6 
 
 		 633 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.92 
 
 		 774 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  30.83 
 
 		 2182 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  23.98 
 
 		 589 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  22.51 
 
 		 601 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  24.59 
 
 		 600 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  23.08 
 
 		 589 aa  47.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.84 
 
 		 2852 aa  47.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  24.22 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  35.71 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  30.28 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  31.13 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  25.1 
 
 		 622 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  26.35 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  33.09 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 1795 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 629 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>