More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1392 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  100 
 
 
1355 aa  2678    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  61.21 
 
 
808 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  49.23 
 
 
657 aa  569  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  53.7 
 
 
592 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  56.25 
 
 
539 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  56.05 
 
 
539 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.33 
 
 
3977 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  46.72 
 
 
748 aa  502  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  52.52 
 
 
533 aa  486  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.74 
 
 
2667 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.49 
 
 
2775 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  45.65 
 
 
726 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.73 
 
 
668 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  49.9 
 
 
551 aa  459  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  48.8 
 
 
567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  46.3 
 
 
633 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
629 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  45.02 
 
 
1322 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  49.6 
 
 
1587 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  42.6 
 
 
2796 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  47.07 
 
 
600 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  50.19 
 
 
546 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.16 
 
 
774 aa  429  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  46.69 
 
 
576 aa  426  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  46.31 
 
 
857 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  45.36 
 
 
624 aa  416  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.88 
 
 
980 aa  413  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  45.33 
 
 
2701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  43.95 
 
 
575 aa  406  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  42.45 
 
 
622 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  44.99 
 
 
624 aa  400  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  44.1 
 
 
624 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  42.54 
 
 
635 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  44.63 
 
 
624 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  43.35 
 
 
624 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  43.72 
 
 
624 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  43.53 
 
 
624 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  38.01 
 
 
2852 aa  382  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  43.53 
 
 
624 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  43.59 
 
 
624 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  48.53 
 
 
2182 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.88 
 
 
1795 aa  370  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  44.47 
 
 
501 aa  370  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  38.93 
 
 
598 aa  360  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  41.92 
 
 
627 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  43.57 
 
 
498 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  41.47 
 
 
589 aa  352  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  38.38 
 
 
621 aa  348  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  41.56 
 
 
600 aa  347  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  40.47 
 
 
589 aa  346  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  38.85 
 
 
601 aa  344  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  36.66 
 
 
622 aa  334  7.000000000000001e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  41.99 
 
 
506 aa  331  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  38.2 
 
 
599 aa  328  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  54.35 
 
 
1175 aa  304  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.99 
 
 
619 aa  228  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  30.99 
 
 
619 aa  228  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.73 
 
 
613 aa  212  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.18 
 
 
607 aa  175  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.76 
 
 
526 aa  171  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.15 
 
 
712 aa  170  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.26 
 
 
605 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.6 
 
 
520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.14 
 
 
555 aa  167  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2776  5'-Nucleotidase domain protein  32.89 
 
 
603 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  29.52 
 
 
532 aa  155  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.83 
 
 
659 aa  151  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.72 
 
 
657 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  26.32 
 
 
663 aa  147  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.06 
 
 
638 aa  145  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.07 
 
 
627 aa  142  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 
558 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.18 
 
 
587 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.36 
 
 
533 aa  139  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  28.48 
 
 
619 aa  136  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.09 
 
 
529 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.81 
 
 
523 aa  126  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  25.34 
 
 
523 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  27.55 
 
 
581 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.43 
 
 
601 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.39 
 
 
641 aa  113  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.91 
 
 
672 aa  112  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.31 
 
 
607 aa  111  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.09 
 
 
637 aa  106  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.09 
 
 
637 aa  105  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  24.01 
 
 
582 aa  102  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.8 
 
 
508 aa  99.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.8 
 
 
508 aa  99.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.68 
 
 
509 aa  94  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  30.79 
 
 
423 aa  90.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.49 
 
 
772 aa  87.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.49 
 
 
772 aa  87.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.33 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  25.66 
 
 
584 aa  85.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  36.36 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.98 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  23.09 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.54 
 
 
508 aa  84.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  25.63 
 
 
591 aa  83.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.43 
 
 
508 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>