250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1128 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  713    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  36.36 
 
 		 1355 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1121 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2178 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  57.14 
 
 		 4285 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  32.14 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  46.67 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  38.24 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  30.36 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.75 
 
 		 768 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  44.44 
 
 		 998 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  40.23 
 
 		 3209 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.44 
 
 		 998 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.44 
 
 		 1839 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  45.33 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 2704 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 6683 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1037 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 6779 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 2239 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  37.21 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 6662 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  47.13 
 
 		 1037 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  29.1 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 726 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  44.78 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  32.05 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.1 
 
 		 2346 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  34.43 
 
 		 7679 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  27.86 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.37 
 
 		 4106 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.25 
 
 		 1403 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 		 1610 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.78 
 
 		 1883 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 5839 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  45.68 
 
 		 2198 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  40.54 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  45.57 
 
 		 901 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  45.68 
 
 		 2133 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  49.21 
 
 		 2768 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  36.15 
 
 		 7919 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  30.53 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  35.45 
 
 		 889 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 		 589 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.17 
 
 		 4836 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 		 686 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  43.94 
 
 		 813 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 2467 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.2 
 
 		 8321 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32 
 
 		 1610 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  40 
 
 		 621 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  46.88 
 
 		 448 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  41.89 
 
 		 479 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  42.11 
 
 		 1650 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  36.79 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.48 
 
 		 1180 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.62 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  38.04 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  49.28 
 
 		 709 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  35.29 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  51.72 
 
 		 7149 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 		 621 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  32.7 
 
 		 1202 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 		 621 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 		 1017 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 		 5787 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  41.67 
 
 		 5123 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  44 
 
 		 2125 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  55.17 
 
 		 4678 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  48.44 
 
 		 16322 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  46.88 
 
 		 6211 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.86 
 
 		 648 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 		 917 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  45.45 
 
 		 2701 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  37.97 
 
 		 535 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  39.19 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 221 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  41.89 
 
 		 745 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  61.9 
 
 		 2542 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 1400 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30.43 
 
 		 4848 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.36 
 
 		 2105 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.27 
 
 		 2812 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  38.46 
 
 		 475 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  40 
 
 		 4697 aa  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  46.03 
 
 		 4214 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.15 
 
 		 5962 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 		 1795 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.19 
 
 		 1148 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  41.67 
 
 		 5442 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.46 
 
 		 2678 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 260 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>