More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1219 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  100 
 
 		 459 aa  942    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  55.9 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  46.67 
 
 		 234 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  36.75 
 
 		 233 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 253 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  33.98 
 
 		 263 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  36.55 
 
 		 252 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  36.84 
 
 		 247 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  37.39 
 
 		 236 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  37.39 
 
 		 236 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  37.39 
 
 		 236 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  35.89 
 
 		 268 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  32.11 
 
 		 271 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  32.93 
 
 		 271 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  31.4 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  34.54 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  36.04 
 
 		 252 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  34.72 
 
 		 273 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  34.72 
 
 		 295 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  34.72 
 
 		 273 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 258 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  34.26 
 
 		 258 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  32.53 
 
 		 269 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  33.87 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  32.53 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  36.99 
 
 		 251 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  33.19 
 
 		 246 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 246 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  30.83 
 
 		 241 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  32.08 
 
 		 249 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.19 
 
 		 264 aa  147  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  33.94 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 253 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  35.71 
 
 		 269 aa  144  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  31.33 
 
 		 249 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  35.02 
 
 		 254 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  32.39 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  32.39 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  34.39 
 
 		 649 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  32.8 
 
 		 264 aa  140  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  33.33 
 
 		 237 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  33.49 
 
 		 242 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  31.33 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  31.45 
 
 		 254 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  34.63 
 
 		 288 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  34.47 
 
 		 253 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 242 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  29.84 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  34.52 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  32.52 
 
 		 243 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  35.74 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  32.41 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  33.17 
 
 		 250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  30.52 
 
 		 464 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.5 
 
 		 415 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  32.21 
 
 		 247 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  32.21 
 
 		 247 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  33.67 
 
 		 249 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  32.32 
 
 		 247 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  34.53 
 
 		 272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  28.12 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  35.9 
 
 		 400 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  30.92 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  27.66 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  35.26 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.03 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  30.77 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  34.17 
 
 		 241 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  31.92 
 
 		 284 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  33.33 
 
 		 474 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  31.98 
 
 		 369 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  31.22 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  30.89 
 
 		 270 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0432  ABC transporter related  32.66 
 
 		 249 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  33.33 
 
 		 474 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  29.55 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  31.05 
 
 		 246 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  32.32 
 
 		 254 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  32.32 
 
 		 254 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 411 aa  123  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  32.32 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  28.69 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  32.32 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  32.16 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  28.1 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  31.12 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  28.23 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  31.82 
 
 		 870 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  33.94 
 
 		 290 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  31.31 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  33.67 
 
 		 249 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  28.45 
 
 		 262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>