More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 393 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 393 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  43.4 
 
 		 438 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  45.19 
 
 		 711 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.86 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  41.53 
 
 		 450 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 390 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.92 
 
 		 435 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 415 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  39.11 
 
 		 498 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  42.37 
 
 		 493 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  42.19 
 
 		 424 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 549 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  43.78 
 
 		 429 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  40.77 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  42.13 
 
 		 472 aa  198  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  43.44 
 
 		 816 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  41.08 
 
 		 472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  41.49 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  40.24 
 
 		 478 aa  195  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  41.46 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  41.77 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  39.67 
 
 		 464 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  40.93 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  41.02 
 
 		 418 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40.94 
 
 		 455 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 		 429 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  42.8 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.67 
 
 		 443 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  43.36 
 
 		 472 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  47 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  40.41 
 
 		 468 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  42.86 
 
 		 394 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  44.76 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 440 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  41.67 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 469 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  43.16 
 
 		 406 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  40.68 
 
 		 436 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  43.05 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  40.5 
 
 		 488 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  39.74 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  38.91 
 
 		 422 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.77 
 
 		 415 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 		 416 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.86 
 
 		 432 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  38.75 
 
 		 456 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 465 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 469 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 471 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  40.08 
 
 		 870 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 465 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  40.16 
 
 		 449 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  41.35 
 
 		 447 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  39.11 
 
 		 457 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.85 
 
 		 649 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  45.83 
 
 		 397 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  45.83 
 
 		 397 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  38.61 
 
 		 428 aa  185  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.3 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  40.53 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  41.7 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 549 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 549 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 549 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  38.49 
 
 		 435 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  37.97 
 
 		 424 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.45 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  40 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  40.34 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  41.95 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  45.73 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 448 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  41.18 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.52 
 
 		 454 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.21 
 
 		 410 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 396 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 433 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  41.03 
 
 		 406 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  43.04 
 
 		 421 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  41.29 
 
 		 437 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  40.83 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  39.32 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  44.9 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  45.92 
 
 		 243 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  43.67 
 
 		 421 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  42.79 
 
 		 422 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 428 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.23 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40.25 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.75 
 
 		 605 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 405 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.57 
 
 		 417 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>