More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1474 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.2 
 
 
465 aa  919    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.44 
 
 
469 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.42 
 
 
465 aa  923    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
469 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.2 
 
 
465 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.2 
 
 
465 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.2 
 
 
465 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  97.44 
 
 
471 aa  927    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  54.8 
 
 
455 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  53.04 
 
 
472 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  51.89 
 
 
440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  50.32 
 
 
448 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  47.07 
 
 
464 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  42.98 
 
 
437 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  43.88 
 
 
450 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.57 
 
 
454 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  40.61 
 
 
449 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.55 
 
 
488 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.3 
 
 
443 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.47 
 
 
429 aa  297  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  41.65 
 
 
438 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  58.75 
 
 
816 aa  292  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  39.51 
 
 
432 aa  290  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  43.57 
 
 
472 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  38.61 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  40.99 
 
 
456 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  53.7 
 
 
435 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  40.04 
 
 
870 aa  273  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  36.62 
 
 
711 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  52.59 
 
 
472 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  48.98 
 
 
457 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37.47 
 
 
405 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  53.31 
 
 
498 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.41 
 
 
405 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  33.41 
 
 
410 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  40.57 
 
 
424 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
393 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
393 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  54.37 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.82 
 
 
478 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.25 
 
 
409 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  34.61 
 
 
493 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  36.82 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.74 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  34.45 
 
 
423 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  48.03 
 
 
254 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 
416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  36.22 
 
 
406 aa  239  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  38.72 
 
 
407 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.96 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.84 
 
 
418 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  36.72 
 
 
410 aa  236  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  53.95 
 
 
260 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  46.37 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  45.56 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.4 
 
 
421 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.4 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  45.39 
 
 
424 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  46.88 
 
 
427 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  45.75 
 
 
244 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  42.06 
 
 
246 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  47.53 
 
 
411 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
411 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 
422 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  46.85 
 
 
422 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  50.22 
 
 
428 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.97 
 
 
429 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  37.76 
 
 
406 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  48.61 
 
 
420 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  32.24 
 
 
394 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  53.96 
 
 
422 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  52.5 
 
 
428 aa  227  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.25 
 
 
417 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.2 
 
 
549 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  50.48 
 
 
369 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  45.7 
 
 
435 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  50.75 
 
 
439 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
439 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  35.87 
 
 
408 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  45.04 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
395 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  51.98 
 
 
431 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  51.5 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.1 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  44.94 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  56.38 
 
 
429 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45.28 
 
 
411 aa  220  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.86 
 
 
418 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.48 
 
 
400 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  50.25 
 
 
419 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  44.74 
 
 
433 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  42.91 
 
 
429 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.86 
 
 
402 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  34.04 
 
 
424 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.38 
 
 
429 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  37.02 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  44.62 
 
 
422 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  41.48 
 
 
437 aa  217  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  50 
 
 
420 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>