More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07245 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 433 aa  890    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  55.37 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  56.31 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  62.77 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  52.15 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  46.81 
 
 		 428 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  60.23 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  52 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  55.36 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  43.52 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 		 422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  59.14 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  53.71 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  51.96 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  65.71 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  52.3 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  55.6 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  54.51 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  55.73 
 
 		 418 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  57.41 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  55.04 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  38.89 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  44.22 
 
 		 427 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  40 
 
 		 411 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  61.19 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  40.81 
 
 		 431 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  48.69 
 
 		 422 aa  282  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.09 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 439 aa  279  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  50.34 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  51.3 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.8 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  61.43 
 
 		 419 aa  272  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41.13 
 
 		 427 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  52.63 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  49.23 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45.26 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  36.67 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  34.4 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  50.19 
 
 		 474 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  49.81 
 
 		 474 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.96 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  34.81 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  38.01 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  33.33 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  54.45 
 
 		 649 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  50.49 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  51.5 
 
 		 488 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.05 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  42.51 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  32.33 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  37.5 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  48.22 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  42.86 
 
 		 870 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  32.32 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  48.73 
 
 		 241 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  43.15 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  38.1 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  49.75 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  45.23 
 
 		 816 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  51.34 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  41.24 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  41.24 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  40.7 
 
 		 256 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  38.93 
 
 		 457 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  51.89 
 
 		 493 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  40.84 
 
 		 711 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  50.99 
 
 		 242 aa  212  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  38.85 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  47.74 
 
 		 266 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  49.47 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  40.46 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 262 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  31.25 
 
 		 409 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 245 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.09 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  49.49 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.19 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.18 
 
 		 435 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  48.42 
 
 		 247 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  46 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  33.33 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  31.45 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  40.23 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  35.47 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  45.59 
 
 		 254 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 469 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.45 
 
 		 402 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 		 396 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  45.97 
 
 		 392 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>