More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1574 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  100 
 
 
422 aa  867    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 
418 aa  507  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  52.91 
 
 
397 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.24 
 
 
400 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  48.19 
 
 
413 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 
250 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  46.99 
 
 
254 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  39.38 
 
 
428 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  40.96 
 
 
468 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  46.84 
 
 
424 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.97 
 
 
443 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.06 
 
 
428 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  47.37 
 
 
605 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.99 
 
 
450 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  37.13 
 
 
435 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  44.86 
 
 
649 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  44.02 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  36.12 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
393 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
393 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
390 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.77 
 
 
454 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  36.47 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.13 
 
 
390 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  43.87 
 
 
418 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  45.83 
 
 
870 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
411 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  43.72 
 
 
424 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  44.77 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.2 
 
 
449 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  44.96 
 
 
431 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  44.44 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  41.28 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  49.26 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  44.07 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  45.16 
 
 
435 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  46.26 
 
 
429 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  49.75 
 
 
422 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  40.23 
 
 
429 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
433 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  35.14 
 
 
418 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  48.73 
 
 
437 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  40.66 
 
 
244 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  36.98 
 
 
408 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  41.57 
 
 
488 aa  210  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  33.09 
 
 
711 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  41.44 
 
 
427 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.03 
 
 
421 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  42.17 
 
 
493 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.31 
 
 
433 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  43.3 
 
 
423 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  36.62 
 
 
400 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  36.63 
 
 
407 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  42.92 
 
 
241 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
440 aa  206  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  43.46 
 
 
264 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
411 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
428 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.86 
 
 
256 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  43.64 
 
 
447 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 
422 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  43.11 
 
 
241 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  41 
 
 
415 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  42.5 
 
 
254 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  45.26 
 
 
418 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  46.41 
 
 
246 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
245 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  45.15 
 
 
397 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  45.15 
 
 
397 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  46.89 
 
 
420 aa  203  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  36.3 
 
 
409 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  40.23 
 
 
427 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  38.7 
 
 
427 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
416 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  38.01 
 
 
427 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  45.16 
 
 
418 aa  202  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
471 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  39.53 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  42.74 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  49.53 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.67 
 
 
247 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  46.57 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  39.51 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  42.36 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  34.38 
 
 
419 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.57 
 
 
429 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  39.15 
 
 
464 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
465 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  42.39 
 
 
247 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  41.91 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  44.59 
 
 
411 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>