More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  75.21 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  74.15 
 
 		 245 aa  358  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  70.46 
 
 		 241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  68.35 
 
 		 241 aa  334  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  63.83 
 
 		 256 aa  321  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  61.37 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 411 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  53.36 
 
 		 266 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  50.85 
 
 		 400 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  51.61 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  47.66 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.37 
 
 		 417 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  45.38 
 
 		 418 aa  241  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  54.85 
 
 		 422 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  46.83 
 
 		 429 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  55.78 
 
 		 411 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  54.23 
 
 		 427 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  45.6 
 
 		 428 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 419 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  53.03 
 
 		 428 aa  237  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  51.47 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  54.31 
 
 		 439 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  50.91 
 
 		 420 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  53.57 
 
 		 369 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 395 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  44.36 
 
 		 431 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  47.74 
 
 		 415 aa  235  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.2 
 
 		 418 aa  234  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  48.16 
 
 		 443 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  53.33 
 
 		 427 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  48.54 
 
 		 420 aa  231  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  48.92 
 
 		 420 aa  230  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.16 
 
 		 420 aa  230  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  53.03 
 
 		 429 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  45.04 
 
 		 468 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  54.21 
 
 		 422 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  45.2 
 
 		 435 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  46.78 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  43.57 
 
 		 419 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  50.98 
 
 		 450 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  46.98 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  51.79 
 
 		 418 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  53.03 
 
 		 427 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  47.28 
 
 		 870 aa  224  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  47.26 
 
 		 432 aa  224  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  45.87 
 
 		 472 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  46.75 
 
 		 408 aa  224  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.37 
 
 		 429 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  46.89 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  45.26 
 
 		 409 aa  223  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  46.29 
 
 		 423 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  47.5 
 
 		 418 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  45.11 
 
 		 425 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  45.9 
 
 		 424 aa  222  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  46.34 
 
 		 472 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  45.9 
 
 		 421 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  49.57 
 
 		 392 aa  221  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  46.19 
 
 		 438 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 431 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  44 
 
 		 435 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  47.41 
 
 		 433 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  45.53 
 
 		 390 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  46.29 
 
 		 429 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 428 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  46.43 
 
 		 420 aa  218  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  45.3 
 
 		 447 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  42.98 
 
 		 816 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.9 
 
 		 454 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  45.41 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45 
 
 		 411 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  50.51 
 
 		 418 aa  214  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  41.13 
 
 		 488 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  45.57 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 		 416 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.86 
 
 		 649 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  44.08 
 
 		 449 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 415 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 471 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 465 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 469 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 465 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 465 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 411 aa  210  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  47.24 
 
 		 410 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  43.22 
 
 		 394 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  50.76 
 
 		 427 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 469 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  43.7 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  44.87 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  45.49 
 
 		 456 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>