More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0848 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  100 
 
 		 418 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  69.23 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  52.34 
 
 		 422 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  46.79 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  54.13 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  46.75 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  50.51 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  58.36 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  52.05 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  59.39 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  59.32 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 431 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  46.11 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  70.44 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  62.31 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  50.75 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  44.04 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  60.31 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  41.8 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  43.91 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  66.97 
 
 		 369 aa  309  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  54.15 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  60.54 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  58.03 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  50.66 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  57.97 
 
 		 419 aa  302  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  46.21 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  44.3 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  41.8 
 
 		 427 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  55.76 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.37 
 
 		 417 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.27 
 
 		 427 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  53.7 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  53.67 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  50.38 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.04 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  51.54 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  51.15 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  48.13 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  47.84 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  47.21 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.39 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  48.84 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  45.35 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  42.12 
 
 		 711 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  34.81 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.82 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  42.32 
 
 		 870 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  47.71 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  39.62 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 245 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.79 
 
 		 247 aa  226  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  37.78 
 
 		 457 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  51.81 
 
 		 264 aa  226  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  42.86 
 
 		 429 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  46.09 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  50.98 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  44.59 
 
 		 407 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  34.25 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.83 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.15 
 
 		 816 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44.23 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  39.31 
 
 		 493 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  48.56 
 
 		 266 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  44.98 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  35.93 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  43.68 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  54.69 
 
 		 649 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.59 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  39.72 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  47.85 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.13 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  48.51 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  51.81 
 
 		 242 aa  214  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  32.29 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  39.02 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  50.5 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  50.25 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  35.1 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  41.4 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  51.3 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  51.52 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  42.11 
 
 		 234 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>