More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3355 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  100 
 
 
429 aa  885    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  64.49 
 
 
428 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  55.9 
 
 
429 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 
422 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  53.88 
 
 
418 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  55.08 
 
 
429 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  50.12 
 
 
418 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  60.07 
 
 
420 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  58.46 
 
 
437 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  46.17 
 
 
439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  47.7 
 
 
411 aa  355  8.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
439 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  48.49 
 
 
421 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  47.42 
 
 
427 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  47.43 
 
 
419 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  51.77 
 
 
369 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
419 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  53.75 
 
 
422 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  70.11 
 
 
420 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  47.67 
 
 
422 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  49.22 
 
 
435 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  46.95 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  46.44 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.98 
 
 
420 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.74 
 
 
417 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  52.19 
 
 
427 aa  332  9e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  60.7 
 
 
431 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  54.22 
 
 
415 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  61.03 
 
 
428 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  44.27 
 
 
422 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  62.31 
 
 
418 aa  316  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  44.47 
 
 
418 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
433 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  50.76 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  45.83 
 
 
433 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
431 aa  298  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  53.58 
 
 
427 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.21 
 
 
427 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  46.8 
 
 
411 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  48.49 
 
 
395 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  38.63 
 
 
474 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  38.41 
 
 
474 aa  286  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  45.19 
 
 
422 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  40.75 
 
 
424 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  39.8 
 
 
450 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  44.73 
 
 
443 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  52 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  49.42 
 
 
438 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
245 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  48.8 
 
 
429 aa  245  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  38.66 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  50.62 
 
 
870 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 
416 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
411 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  50.42 
 
 
816 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  34.1 
 
 
425 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  47.47 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  47.55 
 
 
464 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  50.23 
 
 
266 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  51.67 
 
 
264 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  49.22 
 
 
472 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  36.73 
 
 
468 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  41.03 
 
 
409 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  53.24 
 
 
456 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  55.5 
 
 
256 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  44.83 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  46.82 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  46.96 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  36.93 
 
 
410 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  49.17 
 
 
488 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.36 
 
 
390 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
262 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  48.86 
 
 
408 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  53.03 
 
 
247 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.86 
 
 
432 aa  230  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  47.44 
 
 
472 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  45.86 
 
 
397 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  45.86 
 
 
397 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  41.76 
 
 
472 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  47.04 
 
 
478 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  48.8 
 
 
241 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.93 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  54.69 
 
 
420 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  35.82 
 
 
436 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  50.24 
 
 
649 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50.99 
 
 
254 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  36.1 
 
 
449 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  37.28 
 
 
429 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  44.79 
 
 
261 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  43.8 
 
 
711 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  38.32 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>