More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1417 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 411 aa  838    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  64.12 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  47.46 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  47.12 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  60.23 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  49.86 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  46.02 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  48.46 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  56.46 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  53.12 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  50.76 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  47.95 
 
 		 439 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 422 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  42.75 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  68.29 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  55.32 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  57.92 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.69 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  54.2 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  43.5 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  58.49 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  56.44 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  59.92 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  54.85 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  47.11 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  65.85 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  56.77 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  59.92 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  65.53 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  45.94 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.81 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  55.64 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  42.9 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  42.62 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  49.51 
 
 		 427 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  43.4 
 
 		 433 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  49.06 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  42.9 
 
 		 421 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  49.24 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  46.32 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  45.69 
 
 		 429 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  45.6 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  36.84 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  49.75 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  53.76 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  53.16 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  52.33 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  53.19 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.66 
 
 		 816 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  50 
 
 		 870 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  50.79 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  48.37 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  49.75 
 
 		 649 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  49 
 
 		 266 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  51.78 
 
 		 456 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.08 
 
 		 247 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  42.48 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  42.48 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  51.6 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  51.34 
 
 		 264 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 245 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  53.19 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  45.08 
 
 		 242 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  49 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.94 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.57 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  50.53 
 
 		 241 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  53.23 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  52.66 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  48.42 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  41.57 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 262 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.18 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.08 
 
 		 256 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  40.32 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  46.19 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  50.81 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  45.38 
 
 		 711 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.08 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  50 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  48.53 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  48.02 
 
 		 472 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  41.89 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  47.66 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  47.34 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  47.34 
 
 		 253 aa  200  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  48.44 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  46.51 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  51.79 
 
 		 247 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  51.35 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>