More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2358 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  100 
 
 		 421 aa  869    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  49.88 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  49.64 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  46.68 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  49.29 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  48.49 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  48.44 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  43.29 
 
 		 420 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  62.07 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  44.93 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  44.39 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.86 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  59.85 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 431 aa  316  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  61.66 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  60.31 
 
 		 418 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  56.95 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  40.82 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  44.88 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  41.08 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  51.79 
 
 		 422 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  53.8 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  52.01 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  46.03 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  49.36 
 
 		 369 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  56.49 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  41.15 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  44.48 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  43.08 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  42.74 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  39.53 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.38 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  45.4 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  38.63 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  38.63 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  53.67 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.19 
 
 		 427 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  47.6 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  56.72 
 
 		 422 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  50.99 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.71 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  50.98 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  47.41 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  46.56 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  48.43 
 
 		 450 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  45.1 
 
 		 870 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  47.15 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  48.39 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  46.56 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  48.61 
 
 		 488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  46.09 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.88 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  44.32 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  41.61 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  51.39 
 
 		 254 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  47.15 
 
 		 816 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  46.84 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  51.18 
 
 		 241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  45.17 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  36.78 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  49.18 
 
 		 256 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.68 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  45.56 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  45.6 
 
 		 711 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  50.67 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.78 
 
 		 244 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  51.71 
 
 		 241 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  34.77 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  46.8 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  44.84 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  44.22 
 
 		 493 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  47.37 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  43.8 
 
 		 478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  49.75 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  47.64 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  46.4 
 
 		 498 aa  226  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  45.82 
 
 		 392 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 234 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  45.58 
 
 		 246 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  48.05 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.09 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  45.68 
 
 		 234 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.48 
 
 		 649 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>