More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0705 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  91.88 
 
 		 234 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  46.09 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  48.92 
 
 		 408 aa  231  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 419 aa  231  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  48.05 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  49.33 
 
 		 407 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 411 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.81 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  45.27 
 
 		 421 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  49.77 
 
 		 254 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  48.65 
 
 		 423 aa  221  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.19 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  45.65 
 
 		 424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  48.98 
 
 		 435 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.16 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  43.32 
 
 		 429 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  48.44 
 
 		 472 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  50 
 
 		 816 aa  218  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  46.46 
 
 		 438 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.92 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  43.72 
 
 		 429 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  42 
 
 		 428 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  42.4 
 
 		 428 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  45.33 
 
 		 409 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  42.86 
 
 		 437 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  45.61 
 
 		 264 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  50.53 
 
 		 433 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  44.58 
 
 		 420 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  47.84 
 
 		 420 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  43.55 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.28 
 
 		 418 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  43.48 
 
 		 439 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  48.26 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  41.46 
 
 		 420 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.98 
 
 		 454 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  45.85 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  44.63 
 
 		 418 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  42.11 
 
 		 429 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  43.61 
 
 		 711 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.25 
 
 		 411 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  44.54 
 
 		 443 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  45.45 
 
 		 450 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.61 
 
 		 390 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  49.47 
 
 		 449 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 390 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.17 
 
 		 244 aa  207  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  39.84 
 
 		 418 aa  207  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  44.53 
 
 		 422 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  49.48 
 
 		 474 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  49.48 
 
 		 474 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  45.38 
 
 		 422 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  45.33 
 
 		 424 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 395 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  51.6 
 
 		 422 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  45.41 
 
 		 447 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 422 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 393 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 393 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  45.45 
 
 		 478 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  49.52 
 
 		 254 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  45.61 
 
 		 411 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  49.52 
 
 		 254 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  49.52 
 
 		 254 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  45 
 
 		 488 aa  204  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  49.74 
 
 		 439 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  46.7 
 
 		 456 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.54 
 
 		 432 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  41.41 
 
 		 431 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  43.4 
 
 		 420 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  47.03 
 
 		 468 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.74 
 
 		 415 aa  202  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.61 
 
 		 429 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  47.4 
 
 		 369 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  46.72 
 
 		 392 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  43.97 
 
 		 870 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.15 
 
 		 427 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.39 
 
 		 420 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  39.68 
 
 		 418 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 		 416 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  40 
 
 		 435 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  42.42 
 
 		 472 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  42.62 
 
 		 455 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  44.64 
 
 		 464 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.92 
 
 		 493 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  45.27 
 
 		 427 aa  198  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 433 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.85 
 
 		 427 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  40.87 
 
 		 472 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  40.52 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.52 
 
 		 649 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  40 
 
 		 430 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  39.91 
 
 		 446 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  44.39 
 
 		 410 aa  194  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  46.7 
 
 		 435 aa  194  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>