More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0191 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  55.46 
 
 
399 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  49.6 
 
 
424 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  51.26 
 
 
409 aa  255  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  49.79 
 
 
423 aa  254  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  50.63 
 
 
407 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  48.35 
 
 
244 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 
418 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  51.12 
 
 
428 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
393 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
393 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
413 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.99 
 
 
397 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  46.47 
 
 
649 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  45.08 
 
 
422 aa  238  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.99 
 
 
400 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.22 
 
 
256 aa  234  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  47.95 
 
 
438 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  48.09 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  49.58 
 
 
408 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.81 
 
 
247 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  47.37 
 
 
450 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  53.88 
 
 
422 aa  232  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
411 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  44.44 
 
 
427 aa  231  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  44.67 
 
 
424 aa  231  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  47.18 
 
 
711 aa  231  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  52.88 
 
 
411 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  43.49 
 
 
433 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.96 
 
 
428 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  46.8 
 
 
468 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.74 
 
 
418 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 
390 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  46.06 
 
 
390 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  45.9 
 
 
443 aa  228  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  50.25 
 
 
435 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  45.17 
 
 
415 aa  228  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  50.42 
 
 
435 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  48 
 
 
241 aa  228  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  47.26 
 
 
254 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  50 
 
 
420 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  47.54 
 
 
870 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.51 
 
 
417 aa  224  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  45.14 
 
 
429 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  44.9 
 
 
400 aa  224  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
262 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  47.52 
 
 
429 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
422 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.15 
 
 
418 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.31 
 
 
420 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  45.15 
 
 
254 aa  223  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
419 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.92 
 
 
421 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  45.42 
 
 
816 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.12 
 
 
493 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  44.57 
 
 
429 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  46.31 
 
 
498 aa  221  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  42.97 
 
 
419 aa  221  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  47.33 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  46.58 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  46.06 
 
 
425 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  43.67 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  48 
 
 
430 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  44.26 
 
 
429 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  47.85 
 
 
439 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  41.98 
 
 
439 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  44.8 
 
 
411 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  43.59 
 
 
242 aa  218  7e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  47.06 
 
 
392 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  45.53 
 
 
420 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  50.23 
 
 
420 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  49.75 
 
 
446 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  47.98 
 
 
418 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  44.57 
 
 
437 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.77 
 
 
427 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  46.25 
 
 
472 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  50.97 
 
 
428 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.39 
 
 
605 aa  215  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  46.44 
 
 
472 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  43.86 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  44.92 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  49.5 
 
 
369 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.78 
 
 
488 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  41.86 
 
 
431 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  42.06 
 
 
472 aa  212  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  45.04 
 
 
432 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.15 
 
 
454 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.43 
 
 
449 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
254 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
234 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  44.02 
 
 
394 aa  208  5e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.32 
 
 
247 aa  208  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  45.45 
 
 
246 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.19 
 
 
415 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  48.22 
 
 
410 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
415 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  48.28 
 
 
435 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  48.57 
 
 
427 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>