More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4465 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  100 
 
 
649 aa  1351    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  57.85 
 
 
244 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  55.65 
 
 
247 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  50.81 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  51.88 
 
 
254 aa  271  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  50.85 
 
 
438 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  48.43 
 
 
254 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 
254 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  46.82 
 
 
254 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  48.7 
 
 
450 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  46.06 
 
 
423 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
254 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 
250 aa  238  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.38 
 
 
488 aa  238  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  46.18 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  46.67 
 
 
424 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  51.4 
 
 
416 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.83 
 
 
418 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  44.77 
 
 
429 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 
390 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  52.68 
 
 
422 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
415 aa  233  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  46.59 
 
 
449 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  48.09 
 
 
390 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  46.22 
 
 
472 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  53.96 
 
 
418 aa  232  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  44.96 
 
 
427 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  43.14 
 
 
425 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  51.49 
 
 
427 aa  230  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.76 
 
 
454 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  48.12 
 
 
242 aa  229  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
416 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.75 
 
 
443 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  51.44 
 
 
428 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  53.89 
 
 
437 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  50.71 
 
 
431 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  48.11 
 
 
433 aa  227  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  46.81 
 
 
472 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
419 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
411 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  55.17 
 
 
420 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
439 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  54.36 
 
 
435 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  44.58 
 
 
420 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  44.3 
 
 
408 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  50.7 
 
 
415 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  48.56 
 
 
428 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  50.24 
 
 
429 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.24 
 
 
407 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  44.35 
 
 
420 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
433 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  42.97 
 
 
424 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.72 
 
 
417 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
418 aa  223  7e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  42.76 
 
 
447 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  44.49 
 
 
816 aa  223  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
422 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  44.35 
 
 
422 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.48 
 
 
421 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  50.5 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  42.92 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  44.86 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  50.99 
 
 
420 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  52.71 
 
 
429 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  50 
 
 
369 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  49.06 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  42.68 
 
 
870 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  47.37 
 
 
429 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  49.01 
 
 
411 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.64 
 
 
415 aa  220  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
428 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  54.69 
 
 
418 aa  219  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.11 
 
 
397 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  46.7 
 
 
411 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
395 aa  218  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  43.64 
 
 
409 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  45.76 
 
 
392 aa  217  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.29 
 
 
256 aa  217  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  49.74 
 
 
422 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  43.09 
 
 
472 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  44.89 
 
 
711 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  46.64 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  45.85 
 
 
439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.21 
 
 
400 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  45.1 
 
 
429 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  48.76 
 
 
436 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40.32 
 
 
455 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  44.78 
 
 
400 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  43.28 
 
 
478 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  41.95 
 
 
432 aa  213  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  41.42 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  52.08 
 
 
474 aa  213  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
270 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  43.86 
 
 
418 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.86 
 
 
247 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 
411 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  44.3 
 
 
420 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  51 
 
 
427 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>