More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2026 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  100 
 
 		 420 aa  863    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  55.05 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  59.1 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  50.35 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  47.18 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  46.44 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  45.24 
 
 		 422 aa  326  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  43 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  49.61 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.29 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.42 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  44.55 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  44.55 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  47.01 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  60.31 
 
 		 418 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 		 411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  50.46 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  45.5 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  59.14 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  43.63 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  47.21 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  44.53 
 
 		 420 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  47.35 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  45.88 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  55.39 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  60.15 
 
 		 418 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  43.13 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  42.12 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  56.81 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  52.61 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  43.75 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  55.43 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  65.2 
 
 		 427 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  55.3 
 
 		 439 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  59.13 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  54.14 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.11 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.68 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.68 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.7 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  54.04 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  46.69 
 
 		 422 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  50 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  44.77 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.94 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  50.49 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  49.02 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  51.72 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.23 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  52.48 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.22 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  44.4 
 
 		 816 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  55.17 
 
 		 649 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  48.66 
 
 		 870 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  46.49 
 
 		 488 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  42.29 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  42.59 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  41.85 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  36.12 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.8 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 245 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  48.84 
 
 		 264 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  46.49 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  45.61 
 
 		 424 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.43 
 
 		 247 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  42.58 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  51.92 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  42.11 
 
 		 498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  52.48 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  48.53 
 
 		 456 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  35.28 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  48.51 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  213  5.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  41.55 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  43.82 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  35.33 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  48.76 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 234 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  37.69 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  35.63 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  48.28 
 
 		 493 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 465 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  35.06 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  41.6 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  45.11 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>