More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4245 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  100 
 
 		 425 aa  873    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  43.52 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.33 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.01 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  38.95 
 
 		 423 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  37.5 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  38.22 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 411 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  37.63 
 
 		 411 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  47.5 
 
 		 254 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  38.89 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.08 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  37.82 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.07 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  34.1 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.49 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  51.46 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  38.69 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  36.46 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  35.38 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  39.18 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  36.39 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 262 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  32.93 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  34.52 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.19 
 
 		 870 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  37.57 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  50.62 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  34.76 
 
 		 427 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.07 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  33.59 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  50.22 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  34.6 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.14 
 
 		 649 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  33.76 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  35.47 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.8 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.14 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.09 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41.15 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  34.01 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  33.42 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  38.99 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  33.81 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  49.07 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.26 
 
 		 256 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  31.7 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 416 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  47.85 
 
 		 369 aa  226  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  35.45 
 
 		 421 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  33.5 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  45.34 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  43.95 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  37.09 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  32.29 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 245 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  34.52 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  38.1 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  33.42 
 
 		 406 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  33.74 
 
 		 488 aa  222  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  49.58 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.11 
 
 		 247 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  34.53 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  49.75 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 254 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  32.77 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  49.12 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  32.69 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  32.42 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  43.93 
 
 		 242 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  46.06 
 
 		 250 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  35.34 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  51.42 
 
 		 246 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  33.08 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  47.03 
 
 		 264 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  33.76 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  45.85 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  44.95 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  43.27 
 
 		 246 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.68 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  33.17 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  44.98 
 
 		 266 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  35.53 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  39.24 
 
 		 429 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  33.65 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>