More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2409 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  100 
 
 
415 aa  838    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  43.03 
 
 
390 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
393 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
393 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  59.92 
 
 
711 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  38.5 
 
 
424 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.3 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.8 
 
 
443 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.32 
 
 
870 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  49.17 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  47.23 
 
 
438 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  37.13 
 
 
456 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.61 
 
 
816 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 
416 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  37.19 
 
 
450 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.17 
 
 
408 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.7 
 
 
432 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  34.64 
 
 
407 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  34.79 
 
 
409 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  42.59 
 
 
468 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  38.52 
 
 
488 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
448 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  34.28 
 
 
423 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  47.7 
 
 
472 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  43.54 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  33.72 
 
 
436 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  46.72 
 
 
464 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.03 
 
 
472 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 
440 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.7 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  44.49 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  38.55 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  47.03 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  32.94 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
469 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.93 
 
 
410 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.31 
 
 
454 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
465 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
471 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
465 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
465 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.97 
 
 
424 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
469 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  42.75 
 
 
400 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  35 
 
 
424 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  45.75 
 
 
416 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  41.6 
 
 
427 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  48.17 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  37.82 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  47.26 
 
 
649 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  34.96 
 
 
457 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  38.06 
 
 
394 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  42.63 
 
 
392 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  46.52 
 
 
428 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  45.61 
 
 
447 aa  229  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  44.68 
 
 
241 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  30.86 
 
 
412 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  47.13 
 
 
549 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  38.03 
 
 
431 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  47.49 
 
 
439 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  32.16 
 
 
422 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  32.22 
 
 
425 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.2 
 
 
421 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.31 
 
 
421 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  36.02 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  31.85 
 
 
429 aa  225  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.67 
 
 
415 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  30.05 
 
 
424 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.85 
 
 
420 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 
594 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.93 
 
 
417 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  43.4 
 
 
241 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  39.52 
 
 
418 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  34.19 
 
 
427 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  41.38 
 
 
415 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  40.29 
 
 
369 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  33.88 
 
 
411 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  37.42 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  45.76 
 
 
242 aa  223  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.87 
 
 
427 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.66 
 
 
405 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  45.11 
 
 
244 aa  222  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  33.78 
 
 
605 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  42.39 
 
 
246 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  37.54 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.37 
 
 
256 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  35 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  34.04 
 
 
395 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
439 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  42.34 
 
 
422 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  43.48 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  49.58 
 
 
549 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  49.58 
 
 
549 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  49.58 
 
 
549 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  44.02 
 
 
264 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>