More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0053 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  61.41 
 
 
605 aa  326  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  58.85 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  58.92 
 
 
247 aa  304  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  57.85 
 
 
649 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  52.32 
 
 
254 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  48.77 
 
 
450 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  46.67 
 
 
438 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
254 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  48.35 
 
 
250 aa  246  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  49.17 
 
 
254 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  48.96 
 
 
424 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  47.66 
 
 
407 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  48.95 
 
 
443 aa  241  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  48.96 
 
 
249 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  48.32 
 
 
408 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  48.52 
 
 
429 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  47.06 
 
 
409 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  46.47 
 
 
711 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.09 
 
 
454 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  53.17 
 
 
816 aa  234  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  48.32 
 
 
472 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  45.49 
 
 
488 aa  232  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  50.73 
 
 
449 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  54.04 
 
 
427 aa  231  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  46.56 
 
 
468 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  47.64 
 
 
423 aa  231  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
411 aa  231  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
469 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  45.96 
 
 
456 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  50.49 
 
 
439 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  44.13 
 
 
435 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.78 
 
 
421 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  45.71 
 
 
457 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
416 aa  228  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  43.33 
 
 
424 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 
422 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
469 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.19 
 
 
493 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53 
 
 
417 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
465 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
465 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
465 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
465 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
465 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
471 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  45.23 
 
 
247 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  45.23 
 
 
247 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  45.64 
 
 
246 aa  224  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  50.25 
 
 
455 aa  224  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  49.3 
 
 
420 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  42.04 
 
 
429 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
418 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  47.06 
 
 
418 aa  222  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.58 
 
 
400 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  45.23 
 
 
424 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  51.96 
 
 
369 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  43.32 
 
 
446 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  52 
 
 
419 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  49.02 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
415 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  53.73 
 
 
429 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  51.76 
 
 
428 aa  221  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  42.8 
 
 
478 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  45.11 
 
 
253 aa  221  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  43.9 
 
 
435 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  47.14 
 
 
420 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
448 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  49.75 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  45.23 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  44.92 
 
 
472 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.19 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  49.75 
 
 
422 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  45.38 
 
 
870 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  50 
 
 
411 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  44.92 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  42.51 
 
 
430 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  46.19 
 
 
392 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.03 
 
 
415 aa  218  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  45.28 
 
 
420 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  46.77 
 
 
422 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  50.25 
 
 
464 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  55.32 
 
 
429 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  47.32 
 
 
418 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  51.96 
 
 
428 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
390 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.46 
 
 
397 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  48.08 
 
 
427 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.76 
 
 
415 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  51 
 
 
422 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  48.02 
 
 
433 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  44.77 
 
 
390 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  51.76 
 
 
427 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  46.03 
 
 
472 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  51 
 
 
418 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  43.58 
 
 
420 aa  214  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  50.25 
 
 
439 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>