More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5891 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  100 
 
 		 418 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  80.95 
 
 		 420 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  58 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  43.7 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  40.38 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  51 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  42.15 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50.42 
 
 		 254 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  36.87 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.21 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  53.39 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  49.19 
 
 		 264 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  51.08 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.6 
 
 		 256 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.77 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  35 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  48.31 
 
 		 870 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  49.56 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  51.82 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  46.59 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  44.04 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  50.62 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  39.7 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 245 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.89 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  52.4 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  50.44 
 
 		 241 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  44.9 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  49.58 
 
 		 241 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  46.53 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  46.32 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  46.28 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.05 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.95 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.72 
 
 		 247 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  50 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  46.64 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  53.65 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  52.08 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  47.92 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  45.12 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.49 
 
 		 437 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  54.17 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  50.91 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  45.77 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 296 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.21 
 
 		 816 aa  222  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  50.49 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  46.72 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  45.83 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  47.9 
 
 		 254 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  49.12 
 
 		 447 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  47.9 
 
 		 254 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  53.72 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  48.7 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  51.83 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  51.92 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 262 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  44.44 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  40.07 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  47.32 
 
 		 244 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  46.85 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  53.68 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  44.49 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  48.65 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 		 250 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.49 
 
 		 474 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  36.64 
 
 		 412 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  35.37 
 
 		 424 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.49 
 
 		 474 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.3 
 
 		 488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  47.17 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  47.3 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  43.72 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  46.58 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  36.59 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  50.5 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.86 
 
 		 649 aa  213  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  48.97 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  48.67 
 
 		 234 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.13 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 234 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  43.17 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  44.88 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  43.02 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  45.74 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  47.21 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>