More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0293 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  100 
 
 
397 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  100 
 
 
397 aa  815    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  52.72 
 
 
435 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  50.84 
 
 
430 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  53.25 
 
 
446 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  48.51 
 
 
429 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  45.86 
 
 
429 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.28 
 
 
428 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  46.99 
 
 
429 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
428 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  35.71 
 
 
418 aa  222  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  46.28 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  33.16 
 
 
411 aa  219  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  44.84 
 
 
439 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  43.5 
 
 
420 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0093  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
406 aa  216  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  40.64 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  50.5 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50.49 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  44.22 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.83 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 
433 aa  213  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  52.36 
 
 
422 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  44.09 
 
 
428 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  53.51 
 
 
488 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  31.22 
 
 
424 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  38.7 
 
 
420 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  33.25 
 
 
431 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  48.79 
 
 
435 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  44.44 
 
 
244 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  43.32 
 
 
427 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
411 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.77 
 
 
421 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  42.8 
 
 
450 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  37.2 
 
 
422 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  43.14 
 
 
261 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  44.21 
 
 
420 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  50.25 
 
 
247 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  42.51 
 
 
429 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.62 
 
 
649 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 
390 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  39.86 
 
 
422 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  49.01 
 
 
439 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.04 
 
 
256 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.46 
 
 
390 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  44.4 
 
 
423 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  45.34 
 
 
418 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  44.73 
 
 
411 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.38 
 
 
433 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
296 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  45.15 
 
 
422 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  48.08 
 
 
418 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  51.04 
 
 
254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  50.26 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  43.7 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  38.28 
 
 
427 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  40.23 
 
 
457 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  42.8 
 
 
266 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  47.37 
 
 
472 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  50.26 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  47.4 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  41.67 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  44.85 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.18 
 
 
454 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  36.36 
 
 
443 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  49.74 
 
 
474 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  34.38 
 
 
400 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  46.84 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  41.08 
 
 
419 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  48.06 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  44.07 
 
 
418 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  43.58 
 
 
254 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 
254 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.36 
 
 
870 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
254 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  39.62 
 
 
472 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  50.54 
 
 
468 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  49.21 
 
 
253 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  29.7 
 
 
433 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  49.74 
 
 
420 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  47.89 
 
 
246 aa  192  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  49.74 
 
 
427 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
418 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  37.26 
 
 
427 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  49.73 
 
 
246 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2250  ABC transporter related  41.18 
 
 
422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.55 
 
 
493 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  45.45 
 
 
407 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.39 
 
 
816 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.4 
 
 
400 aa  189  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  39.84 
 
 
711 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.53 
 
 
435 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
469 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40.85 
 
 
416 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  31.36 
 
 
424 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>