More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2250 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2250  ABC transporter related  100 
 
 		 422 aa  871    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  32.71 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  41.39 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  32.92 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  41.18 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  41.18 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.1 
 
 		 443 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  28.67 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.47 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.5 
 
 		 870 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  36.08 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  32.25 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  31.07 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  31.78 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  37.07 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  42.16 
 
 		 649 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  30.97 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  32.02 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  34.24 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  37.65 
 
 		 488 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  38.73 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  36.36 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  34.83 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.36 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  31.82 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  38.46 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  38.05 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  41.18 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  31.36 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.38 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  42 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  40.89 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  33.33 
 
 		 247 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.1 
 
 		 436 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  34.15 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  42.93 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  38.27 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  40.09 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.36 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  38.86 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  29.84 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  31.45 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.54 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  40.19 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  36.96 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  29.74 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  34.66 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  37.75 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  36.86 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  29 
 
 		 450 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  40.3 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.5 
 
 		 816 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  39.2 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  32.27 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 594 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  36.72 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  36.73 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  30.18 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  33.58 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.22 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  38 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  36.72 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  33.98 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.6 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  34.63 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  35.89 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  27.99 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  26.86 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  26.86 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  31.68 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  28.15 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  38.21 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  31.8 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  35.39 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  35.29 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  34.56 
 
 		 246 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 		 270 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  34.16 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  36.65 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  33.22 
 
 		 435 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  39.5 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  40 
 
 		 247 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  28.79 
 
 		 418 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  40.49 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  40.1 
 
 		 246 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  40.1 
 
 		 246 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  33.33 
 
 		 242 aa  152  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  36.57 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  39.8 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.62 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  42.39 
 
 		 233 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  33.33 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>