More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0731 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.08 
 
 
649 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  41.87 
 
 
450 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
415 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  38.24 
 
 
244 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.91 
 
 
429 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.59 
 
 
247 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  36.29 
 
 
254 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  43.59 
 
 
816 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  38.35 
 
 
488 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.74 
 
 
443 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  40.33 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  40.98 
 
 
261 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  40.08 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.54 
 
 
400 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.71 
 
 
472 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  45.59 
 
 
422 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.37 
 
 
870 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.69 
 
 
409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
296 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.33 
 
 
432 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 
251 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  41.18 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  41.35 
 
 
407 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  39.41 
 
 
424 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  43.56 
 
 
408 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  37.86 
 
 
246 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  40.17 
 
 
472 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  43.48 
 
 
430 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.8 
 
 
415 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  43.66 
 
 
435 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 
416 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  40.57 
 
 
424 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  37.97 
 
 
456 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  36.69 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.75 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.4 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.01 
 
 
454 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  39.57 
 
 
472 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  39.67 
 
 
331 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
419 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  39.06 
 
 
711 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
448 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
393 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
393 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  37.4 
 
 
468 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  38.75 
 
 
392 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.25 
 
 
268 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  40.33 
 
 
397 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  40.93 
 
 
424 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  40.33 
 
 
397 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.74 
 
 
410 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  36.73 
 
 
254 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  33.76 
 
 
605 aa  185  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  36.93 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  39.09 
 
 
390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  39.32 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  37.55 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41.26 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  39.09 
 
 
493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  40.77 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  37.86 
 
 
246 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 
246 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
469 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
465 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
465 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  40.33 
 
 
422 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
465 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
465 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  38.7 
 
 
422 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
471 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
465 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  38.82 
 
 
416 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
253 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.31 
 
 
469 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  38.46 
 
 
252 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.86 
 
 
415 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  37.6 
 
 
457 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  39.32 
 
 
412 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  36.71 
 
 
247 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  36.71 
 
 
247 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  34.9 
 
 
449 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  41.2 
 
 
424 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  39.38 
 
 
420 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  35 
 
 
271 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 
269 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  35.92 
 
 
464 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  38 
 
 
420 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  40.98 
 
 
446 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
428 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.71 
 
 
436 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  37.94 
 
 
428 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  37.71 
 
 
254 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  40.43 
 
 
241 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  40.85 
 
 
241 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
440 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>