More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2056 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  69.51 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  55.28 
 
 		 247 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  57.14 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  53.68 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  48.77 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  48.77 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  51.29 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  51.29 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  51.29 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  47.74 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  47.95 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  47.13 
 
 		 272 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  46.22 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  47.13 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  48.15 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  46.31 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  45.97 
 
 		 273 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  46.09 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  45.97 
 
 		 273 aa  234  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  46.96 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  47.44 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  45.27 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  45.97 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.53 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  42.15 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  41.46 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  41.08 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 439 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  41.39 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  43.59 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.57 
 
 		 649 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  40.49 
 
 		 421 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 393 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 393 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  41.22 
 
 		 605 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  43.43 
 
 		 427 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.84 
 
 		 408 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  39 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  44.95 
 
 		 422 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  38.02 
 
 		 392 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.55 
 
 		 417 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.13 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  41.41 
 
 		 472 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.66 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  44.16 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.82 
 
 		 424 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  42.74 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.3 
 
 		 423 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  35.39 
 
 		 407 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 465 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 465 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 465 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 465 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  44.72 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 465 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 419 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  39.08 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  41.79 
 
 		 439 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 469 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 469 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  41.44 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 471 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  41.12 
 
 		 422 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.64 
 
 		 415 aa  178  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  43.22 
 
 		 429 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  37.04 
 
 		 422 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 415 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.97 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.4 
 
 		 415 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.35 
 
 		 418 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  41.78 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.13 
 
 		 411 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.89 
 
 		 419 aa  174  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.68 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 395 aa  174  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 549 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  37.6 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.85 
 
 		 400 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  37.86 
 
 		 394 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  36.6 
 
 		 450 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  41.79 
 
 		 435 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  34.44 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  35.8 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  40.17 
 
 		 411 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  43.23 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  41.84 
 
 		 464 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  40.4 
 
 		 816 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 		 416 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>