More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2779 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  48.56 
 
 
246 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  51.05 
 
 
269 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  49.17 
 
 
268 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  49.59 
 
 
271 aa  244  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  49.18 
 
 
250 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  49.18 
 
 
250 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  46.89 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  48.1 
 
 
272 aa  242  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  47.68 
 
 
269 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  48.56 
 
 
249 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  48.29 
 
 
295 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  48.29 
 
 
273 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  48.29 
 
 
273 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  47.84 
 
 
236 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  47.84 
 
 
236 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  47.84 
 
 
236 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  45.64 
 
 
247 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  47.23 
 
 
242 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
264 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  48.52 
 
 
249 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  48.18 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  45.27 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  47.73 
 
 
241 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
258 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  43.15 
 
 
258 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  42.63 
 
 
254 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  44.58 
 
 
248 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  46.09 
 
 
233 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  45.38 
 
 
252 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
242 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  38.91 
 
 
271 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  40.65 
 
 
252 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  42.11 
 
 
234 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  40.91 
 
 
250 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  42.49 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.11 
 
 
432 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  36.51 
 
 
241 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  37.13 
 
 
241 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  37.1 
 
 
254 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  37.23 
 
 
246 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
416 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  41.15 
 
 
251 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  38.68 
 
 
392 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  39.29 
 
 
247 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  39.29 
 
 
247 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  42.13 
 
 
237 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.65 
 
 
436 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.41 
 
 
418 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  35.92 
 
 
458 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  33.98 
 
 
459 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  37.55 
 
 
409 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  35.54 
 
 
244 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  37.25 
 
 
407 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.34 
 
 
443 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.93 
 
 
247 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  38.73 
 
 
605 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.54 
 
 
242 aa  167  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
270 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.22 
 
 
454 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  36.48 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  40 
 
 
468 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.94 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  37.69 
 
 
254 aa  165  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  35.25 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.29 
 
 
424 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  35.34 
 
 
449 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  35.84 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  34.71 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
439 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  36.02 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.91 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  34.84 
 
 
254 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  40.49 
 
 
408 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  39.2 
 
 
429 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  33.47 
 
 
478 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7047  putative O-antigen export system ATP-binding protein  40 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  32.95 
 
 
419 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  36.05 
 
 
447 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.76 
 
 
474 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  35.65 
 
 
472 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  36.55 
 
 
437 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
390 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  39.53 
 
 
439 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  34.9 
 
 
422 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.66 
 
 
870 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
422 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  34.39 
 
 
488 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  36.82 
 
 
390 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  39.51 
 
 
428 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.22 
 
 
474 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
245 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  34.25 
 
 
427 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  39.11 
 
 
402 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0575  ABC transporter related  38.24 
 
 
399 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>