More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3138 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  49 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  50.62 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  50 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  50.21 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  50 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  50 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  50 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  49.79 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  47.39 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.18 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  49.79 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  45.73 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  45.12 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  44.58 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  45.12 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  45.12 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  43.39 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  43.9 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  44.77 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  44.13 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  45.7 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  45.7 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  45.7 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  47.5 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  42.98 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  44.44 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  43.88 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  45.18 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 393 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 393 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  40.25 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  36.86 
 
 		 435 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  40.51 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.39 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.08 
 
 		 423 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 594 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.91 
 
 		 408 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  33.19 
 
 		 450 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.96 
 
 		 649 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  34.04 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 390 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.93 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.27 
 
 		 390 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 419 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  36.41 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  39.9 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 415 aa  171  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  39.9 
 
 		 406 aa  171  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  41.45 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.18 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  35.81 
 
 		 427 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  35.42 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  40.93 
 
 		 421 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  42.93 
 
 		 474 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  40.43 
 
 		 456 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  42.93 
 
 		 474 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  34.19 
 
 		 428 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  39.8 
 
 		 421 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  43.3 
 
 		 412 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 416 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  39.32 
 
 		 422 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  37.5 
 
 		 402 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  42.31 
 
 		 431 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.7 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  36.95 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.4 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  40.41 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  39.46 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  36.2 
 
 		 422 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  38.86 
 
 		 816 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  39.69 
 
 		 431 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.23 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  37.62 
 
 		 420 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 429 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 469 aa  165  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 405 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  35.57 
 
 		 407 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 465 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  35.06 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 465 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  39.46 
 
 		 472 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 465 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 465 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 465 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  37.68 
 
 		 425 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 469 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 471 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  38.19 
 
 		 416 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  37.33 
 
 		 411 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  38.22 
 
 		 478 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  38.1 
 
 		 427 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>