More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  55.86 
 
 
288 aa  278  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  51.98 
 
 
290 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  53.04 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  52.73 
 
 
272 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  52.24 
 
 
290 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1685  ABC transporter related  51.98 
 
 
279 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  49.21 
 
 
271 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.42 
 
 
287 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09060  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.45 
 
 
291 aa  220  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0309867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.01 
 
 
352 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  44.78 
 
 
254 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  40.49 
 
 
429 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  44.09 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  41.63 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
469 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  43 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.33 
 
 
264 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  40 
 
 
435 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  41.9 
 
 
424 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  42.53 
 
 
250 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  42.53 
 
 
250 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  43.72 
 
 
435 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 
471 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
469 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
465 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
465 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
465 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
465 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
465 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.62 
 
 
549 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  43.84 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  42.64 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  37.94 
 
 
424 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  43.22 
 
 
456 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.07 
 
 
407 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  42.86 
 
 
412 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  37.97 
 
 
816 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  40.7 
 
 
446 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 
258 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  43.69 
 
 
392 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  39.7 
 
 
258 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.13 
 
 
400 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  40.1 
 
 
468 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
393 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
393 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  44.39 
 
 
266 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  40.91 
 
 
430 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
277 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  46.73 
 
 
429 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 
246 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  36.18 
 
 
248 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  37.93 
 
 
246 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  39.9 
 
 
472 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  35.16 
 
 
427 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.21 
 
 
247 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  38.31 
 
 
428 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  45.45 
 
 
416 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.42 
 
 
264 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.42 
 
 
264 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  38 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  42.64 
 
 
464 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.11 
 
 
424 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  34.77 
 
 
272 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.12 
 
 
443 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.59 
 
 
454 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.89 
 
 
429 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  43.01 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  43.01 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  38.1 
 
 
472 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  39.9 
 
 
711 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  39.09 
 
 
436 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.21 
 
 
415 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
390 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  38.35 
 
 
390 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  40.7 
 
 
422 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  40.85 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  39.44 
 
 
438 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  36.22 
 
 
493 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  37 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  39.61 
 
 
447 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
395 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  38.58 
 
 
449 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.8 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  42.35 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  38.29 
 
 
422 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  37.87 
 
 
411 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  41.67 
 
 
427 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  40.3 
 
 
408 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  39.59 
 
 
423 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  37.69 
 
 
415 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  37.13 
 
 
233 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 
270 aa  161  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  39.55 
 
 
411 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  34.14 
 
 
421 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>