More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8936 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  85.19 
 
 
290 aa  447  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  68.08 
 
 
271 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  61.94 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1685  ABC transporter related  61.54 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  53.38 
 
 
288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
286 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  53.04 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  53.54 
 
 
287 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.62 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09060  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.94 
 
 
291 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0309867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.74 
 
 
352 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  43.07 
 
 
247 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  41.63 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.27 
 
 
244 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.28 
 
 
415 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.68 
 
 
429 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  37.94 
 
 
435 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  37.5 
 
 
468 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  37.61 
 
 
450 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  37.76 
 
 
416 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.78 
 
 
247 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  36.99 
 
 
472 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  40.1 
 
 
436 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  37.66 
 
 
464 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
469 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.52 
 
 
649 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
465 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
465 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
469 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
465 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
465 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
465 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
471 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  36.69 
 
 
488 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
431 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  43.28 
 
 
254 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.69 
 
 
443 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.51 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35.15 
 
 
455 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  38.64 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.96 
 
 
454 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.59 
 
 
549 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  40.2 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  41.79 
 
 
266 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  40 
 
 
256 aa  161  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  39.91 
 
 
253 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
395 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
262 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
393 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
393 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  40.28 
 
 
423 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
448 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  37.67 
 
 
449 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  36.21 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  40.58 
 
 
439 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  34.15 
 
 
252 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  39.52 
 
 
456 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
419 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  37.9 
 
 
421 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  39.42 
 
 
254 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  38.73 
 
 
418 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  37.61 
 
 
424 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  35.92 
 
 
242 aa  159  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
390 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.56 
 
 
390 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  37.68 
 
 
406 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  38.1 
 
 
411 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
245 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  35.69 
 
 
498 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
411 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  38.35 
 
 
250 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  34.31 
 
 
415 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  40.19 
 
 
418 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
296 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  39.9 
 
 
605 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  32.35 
 
 
246 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
246 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.05 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  38.76 
 
 
438 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  36.89 
 
 
420 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  36.05 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  36.74 
 
 
816 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  38.21 
 
 
234 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  40 
 
 
435 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  36.63 
 
 
237 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.34 
 
 
870 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 
422 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  34.84 
 
 
424 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  38.78 
 
 
422 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.59 
 
 
419 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.89 
 
 
549 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  36.32 
 
 
410 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.89 
 
 
549 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  36.41 
 
 
472 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  39.6 
 
 
420 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.89 
 
 
549 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
270 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1285  ABC transporter-related protein  37.07 
 
 
251 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  36.68 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>