More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 
287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  57.3 
 
 
288 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  54.86 
 
 
290 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  54.92 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  52.69 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  52.85 
 
 
290 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  50.2 
 
 
272 aa  251  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1685  ABC transporter related  50.2 
 
 
279 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113717  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.42 
 
 
264 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  56.72 
 
 
352 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09060  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.53 
 
 
291 aa  219  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0309867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  41.6 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  46.79 
 
 
450 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.29 
 
 
488 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.98 
 
 
429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  46.04 
 
 
244 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  44 
 
 
549 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.52 
 
 
415 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  46.53 
 
 
549 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  46.53 
 
 
549 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  44.28 
 
 
649 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  46.53 
 
 
549 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  43.11 
 
 
468 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  38.55 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  45.32 
 
 
435 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  41.23 
 
 
436 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  44.95 
 
 
464 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
390 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  39.91 
 
 
390 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  40.55 
 
 
421 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  45.15 
 
 
472 aa  178  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.73 
 
 
418 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.74 
 
 
429 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
393 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
393 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.4 
 
 
870 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.16 
 
 
816 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  36.84 
 
 
443 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  39.91 
 
 
411 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  40 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  41.23 
 
 
427 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  38.29 
 
 
394 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  44.83 
 
 
446 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.31 
 
 
455 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
416 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  42.23 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.91 
 
 
264 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.82 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  40.91 
 
 
422 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  37.96 
 
 
252 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
419 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
270 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  40.1 
 
 
456 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  43.78 
 
 
430 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  42.93 
 
 
254 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  42.36 
 
 
254 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  44.78 
 
 
438 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  36.1 
 
 
498 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  42.64 
 
 
428 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  39.52 
 
 
422 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.99 
 
 
454 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  40.1 
 
 
402 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 
250 aa  168  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  40.62 
 
 
437 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  40.54 
 
 
253 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.93 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 
594 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.91 
 
 
264 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  41 
 
 
439 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.91 
 
 
264 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  43.28 
 
 
429 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  41.09 
 
 
369 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  38.99 
 
 
449 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  43.06 
 
 
260 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
471 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 
469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  41.79 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
465 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
465 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  42.79 
 
 
428 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.71 
 
 
421 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
431 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  40.3 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  38.28 
 
 
472 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  40.85 
 
 
447 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  37.19 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  40.91 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.6 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  40.8 
 
 
711 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  39.81 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  39.17 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.71 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  37.19 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>