More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3313 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  75.86 
 
 
284 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  71.77 
 
 
271 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1685  ABC transporter related  64.14 
 
 
279 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113717  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  61 
 
 
272 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  57.09 
 
 
288 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
286 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  54.86 
 
 
287 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.98 
 
 
264 aa  268  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.93 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09060  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.55 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0309867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.74 
 
 
352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  40.4 
 
 
331 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  38.17 
 
 
247 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  40.85 
 
 
429 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.83 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.68 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.79 
 
 
450 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  38.91 
 
 
464 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40.17 
 
 
416 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.59 
 
 
549 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  37.34 
 
 
468 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.17 
 
 
415 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  42.23 
 
 
244 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  39 
 
 
472 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  38.2 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  36.36 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
469 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  37.65 
 
 
449 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  44.55 
 
 
254 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  43 
 
 
439 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
419 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
471 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
465 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
469 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
465 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
465 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
465 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
465 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.34 
 
 
549 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.34 
 
 
549 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.34 
 
 
549 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
431 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
448 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
393 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
393 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.34 
 
 
247 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  35.6 
 
 
424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  42.44 
 
 
262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  40.87 
 
 
266 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  35.29 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  42.13 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
395 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.68 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.36 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  36.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  36.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.36 
 
 
870 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  37.39 
 
 
254 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  37.14 
 
 
237 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  36.03 
 
 
605 aa  162  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.9 
 
 
422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
416 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.22 
 
 
418 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  38.46 
 
 
254 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  36.48 
 
 
816 aa  161  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.48 
 
 
456 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  37.75 
 
 
432 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  39 
 
 
246 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40 
 
 
407 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  40.38 
 
 
424 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  39.11 
 
 
369 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  37.76 
 
 
447 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  33.88 
 
 
455 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  36.93 
 
 
493 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  38.69 
 
 
246 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  40.2 
 
 
249 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  38.92 
 
 
419 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  41.26 
 
 
392 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  34.43 
 
 
252 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  40.72 
 
 
256 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  38.16 
 
 
649 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  37.61 
 
 
418 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  35.51 
 
 
472 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  37.61 
 
 
421 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
440 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  36.82 
 
 
498 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  37.31 
 
 
436 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
439 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.08 
 
 
478 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.5 
 
 
264 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.5 
 
 
264 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  36.4 
 
 
711 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  41.18 
 
 
420 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  40.67 
 
 
418 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
422 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  37.39 
 
 
427 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  35.91 
 
 
400 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 
594 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>