More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  100 
 
 
352 aa  703    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  57.49 
 
 
288 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.92 
 
 
290 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
286 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  50.61 
 
 
287 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09060  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.49 
 
 
291 aa  219  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0309867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  46 
 
 
290 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  46.28 
 
 
284 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1680  ABC transporter related  52.45 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.01 
 
 
264 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1685  ABC transporter related  52.74 
 
 
279 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  50.96 
 
 
271 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  35.66 
 
 
549 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  44.08 
 
 
247 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  36.04 
 
 
472 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  41.43 
 
 
244 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  41.53 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  37.86 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  42.73 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  35.78 
 
 
390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.82 
 
 
415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  37.82 
 
 
468 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  37.08 
 
 
247 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  41.55 
 
 
464 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  38.73 
 
 
436 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 
594 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  43.56 
 
 
249 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  37.08 
 
 
649 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.1 
 
 
438 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  35.32 
 
 
258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  40.1 
 
 
429 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  38.54 
 
 
242 aa  166  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.18 
 
 
456 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.86 
 
 
435 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  36.54 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  40.76 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.07 
 
 
549 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.07 
 
 
549 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.07 
 
 
549 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  38.79 
 
 
478 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.12 
 
 
443 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  36.97 
 
 
435 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
469 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  40.28 
 
 
424 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  37.81 
 
 
246 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  37.81 
 
 
246 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  40.8 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  37.55 
 
 
488 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  39.6 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  40.1 
 
 
430 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  40.3 
 
 
246 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.61 
 
 
472 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  39.6 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  38.86 
 
 
446 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.89 
 
 
424 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  36.18 
 
 
457 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
469 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  40.19 
 
 
472 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.48 
 
 
870 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.07 
 
 
454 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
465 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
465 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
465 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.61 
 
 
433 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  36.18 
 
 
427 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  39 
 
 
416 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
465 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
471 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  38.58 
 
 
421 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  35.92 
 
 
271 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  36.26 
 
 
447 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 
418 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  39.89 
 
 
242 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  30.8 
 
 
394 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.94 
 
 
256 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  36.49 
 
 
605 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  37.06 
 
 
396 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  39.9 
 
 
422 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  36.36 
 
 
252 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  36.16 
 
 
416 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  39.6 
 
 
249 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  42.17 
 
 
254 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  35.32 
 
 
247 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  30.06 
 
 
418 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  36.14 
 
 
263 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  38.58 
 
 
420 aa  155  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  35.64 
 
 
422 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  33.33 
 
 
493 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  36.29 
 
 
266 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  37.62 
 
 
816 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  36.95 
 
 
432 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  36.15 
 
 
427 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>