More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0745 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  88.71 
 
 		 249 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  87.95 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  87.95 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  66.67 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  48.77 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  48.97 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  48.97 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  50 
 
 		 277 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  47.54 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  47.95 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  48.35 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  48.78 
 
 		 271 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  47.06 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  48.35 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  48.35 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  48.35 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  46.91 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  49.35 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 242 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  48.18 
 
 		 263 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  46.31 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  47.41 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  46.98 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  46.98 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  50.49 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  44.76 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  43.9 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  46.34 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  43.94 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  38.78 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  44.16 
 
 		 450 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  45.27 
 
 		 424 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  42.64 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.09 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  44.5 
 
 		 439 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  38.72 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  43.94 
 
 		 412 aa  181  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  40.91 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  44.67 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 419 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  37.6 
 
 		 605 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  40.25 
 
 		 392 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  42.11 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  42.5 
 
 		 422 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0575  ABC transporter related  37.19 
 
 		 399 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  42.93 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 469 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  41.36 
 
 		 816 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 393 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 393 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  35.54 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  50.53 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  40.61 
 
 		 419 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  43.72 
 
 		 409 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.28 
 
 		 421 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  44.44 
 
 		 418 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.24 
 
 		 400 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  38.79 
 
 		 408 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  40.91 
 
 		 498 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  40.1 
 
 		 428 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.1 
 
 		 429 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  41.3 
 
 		 407 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 		 429 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 471 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 465 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 469 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 465 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.64 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  39.5 
 
 		 424 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  42.93 
 
 		 472 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  43.43 
 
 		 428 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.15 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  43.78 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  39.29 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  39.29 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 		 422 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.59 
 
 		 649 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  38.33 
 
 		 422 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  42.13 
 
 		 420 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.88 
 
 		 472 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  34.85 
 
 		 711 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  41.12 
 
 		 369 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 390 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  42.13 
 
 		 427 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  36.61 
 
 		 390 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  39.09 
 
 		 435 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  41.07 
 
 		 411 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  39.2 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>