More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0491 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  56.71 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  51.46 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  47.86 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  48.26 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  47.83 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  47.83 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  47.06 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  47.44 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  45.73 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  46.64 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  45.96 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 253 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  47.73 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  45.92 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  45.92 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  46.19 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  46.19 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  45.61 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  45.53 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  45.53 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  45.53 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  41.18 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.72 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  42.98 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  41.13 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  43.72 
 
 		 271 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  37.5 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  47.31 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  39.75 
 
 		 458 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  39.22 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  35.5 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  41.12 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 419 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  43.48 
 
 		 419 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  41.46 
 
 		 411 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  43.3 
 
 		 420 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  37.28 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.69 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  40.97 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 390 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40 
 
 		 390 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  37.44 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  36.75 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  38.1 
 
 		 394 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  39.27 
 
 		 437 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  37.07 
 
 		 427 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.69 
 
 		 474 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  40.5 
 
 		 416 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  40.31 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 433 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  40.72 
 
 		 432 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  43.98 
 
 		 411 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 411 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.33 
 
 		 408 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  39.11 
 
 		 439 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.3 
 
 		 429 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  38.02 
 
 		 422 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  42.93 
 
 		 443 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.53 
 
 		 433 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 439 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  38.24 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  42.93 
 
 		 402 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  43.62 
 
 		 418 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  42.49 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  42.16 
 
 		 420 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.8 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  42.78 
 
 		 418 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  41.88 
 
 		 406 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 431 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7047  putative O-antigen export system ATP-binding protein  38.79 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  40.76 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  39.42 
 
 		 422 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.96 
 
 		 454 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.25 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.44 
 
 		 450 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  37.61 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  39.89 
 
 		 493 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  40.89 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  39.79 
 
 		 428 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40.62 
 
 		 427 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  40.53 
 
 		 415 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  38.28 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 		 416 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  40.98 
 
 		 438 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.86 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.62 
 
 		 418 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.25 
 
 		 417 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  35.98 
 
 		 424 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 465 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 465 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 465 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 465 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>