More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4932 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  44.26 
 
 
249 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  44.76 
 
 
249 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  43.55 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  43.55 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  42.21 
 
 
247 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  42.21 
 
 
246 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  43.53 
 
 
254 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  43.1 
 
 
233 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  41.39 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  42.56 
 
 
258 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
258 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  38.65 
 
 
269 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  40.25 
 
 
248 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  39.44 
 
 
271 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  40.91 
 
 
263 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  42.34 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  42.34 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  42.34 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  38.96 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
253 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  39.18 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  39.67 
 
 
271 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  35.5 
 
 
241 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  38.43 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
242 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  37.34 
 
 
273 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  39.66 
 
 
272 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
264 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
277 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.15 
 
 
268 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  34.24 
 
 
450 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 
269 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 
393 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 
393 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  34.55 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  38.2 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  37.5 
 
 
295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.5 
 
 
264 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.12 
 
 
247 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  39.09 
 
 
237 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
270 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  34.94 
 
 
455 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
465 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  35.08 
 
 
422 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7047  putative O-antigen export system ATP-binding protein  40.35 
 
 
246 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
469 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
469 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  38.35 
 
 
284 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  36.1 
 
 
252 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.61 
 
 
549 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.61 
 
 
264 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.61 
 
 
264 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
471 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  36.51 
 
 
290 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.71 
 
 
549 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  38.81 
 
 
433 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.71 
 
 
549 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  37.71 
 
 
549 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  34.58 
 
 
424 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  34.06 
 
 
649 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  36.82 
 
 
428 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  36.71 
 
 
254 aa  155  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  36.55 
 
 
427 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.39 
 
 
488 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  35.12 
 
 
418 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  37.5 
 
 
252 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
418 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  35.66 
 
 
424 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
419 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  39.59 
 
 
264 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  36.68 
 
 
431 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.36 
 
 
419 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.07 
 
 
415 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
396 aa  151  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 
594 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.67 
 
 
410 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  31.84 
 
 
400 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08850  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  36.8 
 
 
290 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
390 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  34.78 
 
 
390 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  34.17 
 
 
435 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.38 
 
 
472 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  36.95 
 
 
428 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
415 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  36.22 
 
 
242 aa  148  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  37.88 
 
 
456 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  36.04 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  38.38 
 
 
605 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  36.73 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  40.1 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  38.76 
 
 
816 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>