More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7047 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7047  putative O-antigen export system ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  42.21 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  40.09 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  42.06 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  44.02 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  44.02 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  43.97 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  41.63 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  39.22 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  37.93 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  38.79 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  41.03 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  41.13 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  41.81 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  40.35 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  37.61 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  37.61 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  37.61 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  38.6 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.83 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  34.05 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  36.09 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  37.93 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  39.66 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.72 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  34.22 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  36.44 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  37.32 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  40.64 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  33.98 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  36.12 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  36 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  40.32 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  36.02 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  36.02 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  38.54 
 
 		 594 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  38.11 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  35.53 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  35.78 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  35.78 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  39.57 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  36.75 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  36.29 
 
 		 400 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.49 
 
 		 429 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  35.42 
 
 		 430 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  36.12 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  37.3 
 
 		 605 aa  128  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.05 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 418 aa  128  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  39.57 
 
 		 446 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  32.19 
 
 		 458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  39.25 
 
 		 450 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.96 
 
 		 438 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  34.3 
 
 		 649 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  36.45 
 
 		 435 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.09 
 
 		 424 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.05 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 469 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  41.3 
 
 		 433 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  34.71 
 
 		 498 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  41.15 
 
 		 407 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  38.17 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 465 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.61 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 465 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 465 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 465 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 411 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 469 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 471 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 465 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0575  ABC transporter related  34.2 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  34.65 
 
 		 457 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 415 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.51 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  34.82 
 
 		 416 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  36.94 
 
 		 472 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  39.89 
 
 		 397 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  36.32 
 
 		 429 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  39.89 
 
 		 397 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  35.4 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  33.48 
 
 		 468 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.68 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  36.7 
 
 		 474 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>